本記事では、iGEM 2020年に参加した全チームのプロジェクトについてまとめた記事の第四弾になります。(全四回の最終回)。
iGEM 2020では、どのようなテーマがあったのか網羅的にわかるようになっておりますので、ざっと眺めて見てはいかがでしょうか。
第四弾の公式版はこちらから
iGEM2020全チームプロジェクト概要 ~第四弾~
第一弾はこちらから
iGEM2020全チームプロジェクト概要 ~第一弾~
[翻訳版] iGEM2020全チームプロジェクト概要 ~第一弾~
第二弾はこちらから
iGEM2020全チームプロジェクト概要 ~第二弾~
[翻訳版] iGEM2020全チームプロジェクト概要 ~第二弾~
第三弾はこちらから
iGEM2020全チームプロジェクト概要 ~第三弾~
[翻訳版] iGEM2020全チームプロジェクト概要 ~第三弾~
※本まとめは、全てのデータをiGEM2020のオープンなデータから取得しております。
※Google 翻訳を利用しているため、一部翻訳がおかしな部分が存在する可能性があります。そのような記載を発見された場合、該当箇所についてご連絡いただけると助かります。
[翻訳版] iGEM2020全チームプロジェクト概要 ~第四弾~
データの見方
(例) チーム名(チームページリンク付き)
タイトル
要約
Wikiへのリンク
このような構成で、全チームをまとめていきます。
チームリスト
UIUC Illinois
Title
Viralizer Modeling Covid-19 mutations and binding energies to design potential antibodies
Abstract
COVID-19はSARS-COV-2ウイルスによって引き起こされ、これが有効な抗体を発症することが困難である非常に変異型ウイルスです。何千ものスパイクタンパク質突然変異が検出されているが、それらの1％未満の結晶構造を解決した。この不足に対処するために、私達はviralizerを作成しました：26,000を超える突然変異スパイクタンパク質配列およびそれらの対応する構造を含むインタラクティブオンラインデータベース、およびPyrosettaでの相同性モデリングを使用して開発された。これにより、使用者は、タンパク質の機能性および潜在的な抗体との結合に対するスパイクタンパク質変異の効果を分析することが可能になる。スパイクタンパク質データベースは、空間と時間に対するウイルスの伝播を特徴付ける系統発生木と対になっています。また、スパイクタンパク質構造とそれらの結合エネルギーを使用してスパイクタンパク質に結合し、細胞上のAce-2受容体への結合親和性を低下させるために、スパイクタンパク質構造とそれらの結合エネルギーを設計する遺伝的アルゴリズムを開発しました。
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SMS Shenzhen
Title
Special Kit Invented for Parkinson's disease
Abstract
パーキンソン病、患者が静的振戦と剛性を提示する症候群であるParkinson病は、60人を超える人々の主要な病気となっています。この問題は、薬物の効力に深刻な影響を受け、疾患の進行を促進しています。したがって、私たちはスキップ（パーキンソン病のために発明された特別キット）をデザインします。LEDを担持する装置と共に、光誘導性細菌は、まず患者の腸に埋め込まれている。ブレスレットが発生したときに振戦を検出し、L-DOPAを管理し、腸に埋め込まれた装置に信号を送り返す医師に信号を送ります。信号を受信すると、LEDが点灯し、これは光誘導性細菌を誘導してL-DOPAを製造する。即時のフィードバックおよびリモートレギュレーションを達成することができるため、スキップは可変の条件に適用される可能性があります。
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Calgary
Title
Oviita: A Community-Based Approach to Vitamin A Deficiency
Abstract
予防可能な失明および死亡率の主要な主な原因として、ビタミンA欠乏症（VAD）は、特に現像領域において深刻な健康問題です。 Oviitaは、これらの脆弱な地域にVADを持続可能でコミュニティに基づく解決策を備えています。我々の溶液は、ビタミンA前駆体、β-カロチンを製造するように修飾されたヤロウェリーの食糧安全な株を使用します。セルラーゼを産生するためにこの酵母を工学することによって、VADコミュニティはそれを彼ら自身のビタミンAサプリメントとして供給原料として容易に利用可能な植物物質を使用することができる。コミュニティの統合を容易にするために、私たちは地域で利用可能な資源に基づいてバイオリアクターの概要を設計し、環境リスクなしで安全な成長を確実にするために酵母栄養要求性を作りました。また、VID試験を改善するためのビタミンAバイオセンサーを作成し、腸内健康不良、VADへの2つの貢献要因と闘うために酵母の膨大薬を含んでいました。これらのソリューションを通じて、Oviitaは、VADに対する世界的な努力に対する持続可能で地域密接に基づく補助を目指しています。
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UM Macau
Title
Biofilm-Removing E. coli for Aquarium Cleaning (BREAC)
Abstract
バイオフィルムが急速に成長するにつれて、それは水槽および水生生物の内面に付着し、それは定期的に洗浄されない場合に水質を低下させる。しかしながら、大水槽におけるバイオフィルムの除去は時間がかかり、そして洗い流すことによって非効率的な労力に頼る。これらの懸念に対処するために、我々はイコリーミスを検出しそして生分解するために大腸菌のBL21細菌株を設計した。T7プロモーターは、バイオフィルムによって分泌されるシグナル伝達分子AHLを認識するLUXRの発現を推進します。AHLと組み合わせて、LUXRはPLUXRに結合して、接着剤タンパク質、AG43、および消化酵素、DNaseおよびプロテアーゼを発現するであろう。我々の設置的な細菌はバイオフィルムに結合し、それを効率的に分解します。
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NJMU-China
Title
Sound of Silence: Domestic autism screening based on urinary metabolites
Abstract
自閉症スペクトラム障害（ASD）は、その大勢力が過去数十年にわたって劇的に増加するにつれて、家族と社会の両方に重大な負担をもたらします。今日、ASDのスクリーニングは主に行動規模の基盤、遺伝的および代謝的変化を無視しています。その間、それはより低い価格とより高いプライバシーを持つテスト方法を要求します。私たちのプロジェクトは、尿中代謝産物に基づく国内テストのためのテストストリップ、さらに感度を高める並行スクリーニング戦略です。試験片については、尿中セロトニンの全細胞バイオセンサーが埋め込まれており、これは以前はASD開発において重要な役割を果たすことが報告されていた。そして、このプロジェクトのP. aeruginosaのQUROM感知システムを利用してバイオセンサーを構築した。並列スクリーニング戦略に関しては、機械学習アルゴリズムを採用し、ほとんどの不均一患者集団を表すことで最善を奏するスクリーニングのための代謝産物の組み合わせを見つけました。
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Shanghai SFLS SPBS
Title
Not hair die, hair DYE: Biosynthesis of natural hair dyes with engineered bacteria
Abstract
染色剤はますます人気があり、無害な染料の需要は絶えず上昇しています。しかしながら、より一般的な合成染料は髪の毛皮質を損傷し、アレルギーを引き起こす可能性がある。天然染料への注意を高めるにもかかわらず、その生産は限られており、製品は高価です。天然の無害な毛髪染料を量産するために設計された細菌を使用することを提案します。メラニン、インジゴ、ドパクサンチン、およびインドリン - ベタシアニンおよびインドリン - ベタシアニンおよび染色髪を黒、青、および赤に合成しました。生産率を高めるためにVibrio Natriegensを使用しました。 V. Natriegensは、大腸菌よりも早くメラニンを生産する可能性があります。さらに、合成染料が酸化剤および顔料前駆体からなることを考慮すると、酸化症および顔料前駆体を染料毛髪に組み合わせることが想定されています。細菌のラッカーゼを発現し、その活性をテストしました。次に、染色プロトコルを最適化し、潜在的な製品の安全側面について説明します。成功した場合、当社の製品は市場に劇的な変化をもたらし、かなりの社会的利益をもたらします。
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St Andrews
Title
The in-silico design of an environmentally friendly probiotic sunscreen
Abstract
St Andrews IGEMチームは、紫外線に対して保護する新規な皮膚プロバイオティックを作成するために合成生物学を使用しました。現在の日焼け止め剤は、サンゴの漂白応答を増強することが知られている複数の無機ナノ粒子および紫外線吸収化合物を含み、それらを他の環境ストレス因子に対してより脆弱にする。 Nissle E. coliをシャーシとして使用して、強力な光防護化合物、シノリンを表現する生きている日焼け止めを設計しようとしました。私たちの人間の慣習は、バイオセーフティが私たちのプロバイオティックの成功に不可欠であるという信念を強化しました。皮膚と環境の両方の長期植民地化を防ぐために、環境刺激を使用する新しいキルスイッチを開発しました。日焼け止めや遺伝子工学への態度に関する国際調査を実施し、これらのトピックに関する一般的な合意をよりよく理解することを可能にしました。インシリコのモデリングは重要な役割を果たしました。我々は遺伝子回路の動力学をモデル化し、そしてこれらの結果を使用してその進化的安定性を予測した。
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KCL UK
Title
Creation of a 3D-bioprinted polycaprolactone scaffold with mussel-foot protein Pvfp-5β-based bioadhesive coating for biomedical applications.
Abstract
毎年、世界中で25万〜500,000人の個人が脊髄損傷（SCI）に苦しんでいます。 SCIは、脊髄の損傷、続いて複雑な病態生理学的反応と傷害部位の下の神経機能の喪失によって特徴付けられます。影響を受ける地域のグリア瘢痕によって作成された抑制環境と組み合わされたCNSの制限された回生能力は、機能を復元するために多数の課題を負う。 SCIの治療に向けて作業する、私たちは、軸索アタッチメントを促進するために合成ムスクスレルフットタンパク質ベースの生体接着コーティングを組み込んで、そして3D-ビオプレニング法を用いて製造することができる、ポリカプロラクトンからなる生分解性足場を設計およびモデル化した。私たちの足場はカスタマイズ可能で、軸索再成長を地形的に奨励し、背骨の機械的な力に耐えると予測される必要なマイクロアーキテクチャとマクロアーキテクチャを含みます。我々は、その生物療法的使用をよりよく理解するために、我々の選択されたタンパク質PVFP - 5βの物理化学的性質を循環させた。
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Moscow
Title
HaploSense
Abstract
ウイルスが急速に変異するにつれて、1つの種の中で異なる遺伝子型が発生する可能性があります。いくつかのウイルス性疾患のために、遺伝子型検出は治療を成功させるために極めて重要であり、C型肝炎はそれらのうちの1つです。ノーベル賞2020は、肝硬変および肝臓癌を引き起こす主要な世界的な健康問題である肝炎との戦いのために授与されました。C型肝炎は、少なくとも6つの異なる遺伝子型を有するC型肝炎ウイルス（HCV）によって引き起こされる。組換え変異体RF2K / 1Bはロシアで一般的であるが、それはしばしば誤った治療をもたらす遺伝子型1と間違えられることが多い。しかし、ロシアの多くの感染患者は、高価なテストや周辺地域でテストを実行することが不可能であるため、彼らのHCV遺伝子型を知らない。この問題。Haplosenseは、HIVまたはSARS-COV-2を含む任意のRNAウイルスの遺伝子型検出に最適化され、ユニバーサル検出プラットフォームになる可能性があります。
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Worldshaper-Wuhan
Title
miR-155 Sensor based on LncRNA Sequence Predict Chemoresistance in Breast Cancer patients
Abstract
乳がんは女性の中で最も一般的な癌であり、新たに診断された癌の世界的に頻繁に発生する2番目の癌です。化学療法および放射線療法に対する耐性は依然として乳癌患者の治療失敗および死亡の主な要因である。したがって、乳がん患者における化学療法と放射線療法の効果を評価するための、新規、非侵襲的なバイオマーカーの緊急の検索があります。成長数の研究は、乳がん薬および放射線耐性の発生におけるmiR-155の役割を強調しています。さらに、研究は、LNCRNAがmiRNAを競合させるためにスポンジとして作用し、様々な生物学的プロセスに参加することができることを示した。このメカニズムは、miR-155の配列に相補的な結合部位を有するLNCRNAの配列に基づくスポンジRNAが、化学療法の効果を評価するための非侵襲的アプローチを提供するMIR - 155の発現を監視することができるという我々の考えを生じる。乳癌患者における放射線療法
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Korea-SIS
Title
Reducing Post-Harvest Losses During Storage of Grain Crops to Strengthen Food Security in Developing Nations
Abstract
米はアジアの多くの国々のための主食です。米を採取後に特定の条件下で乾燥させる必要があります。そうでなければ、それはその商品性を失い、総歩留まりに影響を与えます。スリランカでは、180万人の農家の生活に影響を与え、毎年23億9,300万ドルに費やされています。米の貯蔵庫に存在する真菌はAspergillus sppです。このプロジェクトでは、アフラトキシンB1の濃度を測定し、Aspergillus sppによって産生された毒素の濃度を測定することによって、イネのための厳格な収穫後の管理システムを確立します。AFB1の濃度を測定するために、我々は酵素、チトクロームP450 1A2を使用した。AFB1とCYP1A2との間の反応は、検出に使用することができるエポキシド残基を有する化合物をもたらす。ここでは、貯蔵米の真菌感染に対する環境要因の依存性の可能性のある影響を捉えるように設計された非パラメトリック・マー・モデルを提案しました。
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Hong Kong HKU
Title
Beyond Unicellular: Recombinase circuits to develop monoculture phenotypic heterogeneity with precise ratiometric control
Abstract
単細胞生物のいくつかの自然な集団は、表現型の変動を維持することによって、独特の高レベルの協力性および労働分割を示し、それはそれらが複雑なタスクを効率的に取り扱うことを可能にする。同様に、設計された細胞の単培養物において高度な区画化を達成することは、医療、産業用途、および環境修復を含む、合成生物学の複数の用途に非常に恩恵を受ける可能性がある。我々のプロジェクトは、低分類由来の遺伝学的配列を確率的に認識および反転するバクテリオファージ由来のCreリコンビナーゼを使用して細胞単培養の安定な表現型変異を創造および維持するのを助けることができる用途の多用途のツールを開発することを目的としています。我々は、Cre酵素において異なる突然変異を導入し、そして細胞表現型のレシオメトリック制御を確立するためのパイロット実験を改善するために、CRE酵素において異なる突然変異を評価した。実験的表現型比を確認するために、表現型比を首尾よく予測し、表現型の個体群の安定性と変動係数との収束を評価する計算シミュレーションを構築しました。
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Peking
Title
Music Updating by Storage and Editing
Abstract
大容量の高密度記憶媒体として、DNAは多くの科学者の関心を集めています。DNAに記憶されている情報を変更するための遺伝子編集方法を用いて情報を記憶するDNAの機能に基づいて、大きな操作性が高い。私たちのプロジェクトでは、音楽情報は大腸菌のプラスミドDNAに設計されたコーディング規則で保存され、遺伝子編集技術は人工突然変異に使用されます。これは、Silico実験でも発生しています。音楽の理論や参照に基づくスコアリングルールは、変更された音楽情報がスクリーニングされ、音楽の進化を達成するために特定の価値のある楽曲が得られます。同時に、ビデオ情報を保存および進化させるための同様の原則と方法を使用しました。一緒に、これは芸術的な創造の生物学的プロセスです、私たちはバイオアートの創造の例を与え、この興味深い方法で創造するためにより多くのアーティストを刺激することを望みます。
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IISER Berhampur
Title
FRaPPe: A FRET based Ranker for Proteins and Peptides
Abstract
チームIGEM Iiser BerhampurによるFrappeは、タンパク質 - タンパク質相互作用（PPI）を標的とする治療薬の効率を検証することを目的とするレポーターシステムです。哺乳動物プロモーター、調節ドメイン（化学的に誘発された二量体化モジュール）、蛍光タグ（蛍光共鳴エネルギー移動モジュール）および目的のタンパク質のコード配列を併用し、そしてヒト胚性腎臓細胞にトランスフェクトされるであろう。このツールは、PPIの程度とそれらの定量化を介して蛍光読み出しを介して、in vitroでこれらの相互作用を減衰させるための薬物効率のためのハイスループットスクリーニングシステムの可能性を提供します。フラッピーの有用性はデングーを破壊する干渉ペプチドを実証しています。このようにウイルス非構造タンパク質および宿主STAT2相互作用は、宿主インターフェロンシグナル伝達経路を調節する。
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Linkoping
Title
ClusteRsy: A user-friendly software for transcriptomic analysis and biomarker discovery
Abstract
喘息は、世界中の339万人の航空気道に影響を与える慢性的かつ炎症性疾患です。まだ具体的な原因や喘息の誘発はまだ不明です。洗練された診断方法と大きなデータの年齢では、強力なアルゴリズムの進歩が従来の方法とは異なるアプローチを提供します。Webベースのソフトウェアクラスティの作成により、生体異性体を必要とせずにRNA-Seqデータを分析するために臨床医や生物学者が任意のRNA-Seqデータを分析することができました。クラスティの使用と我々の設計されたワークフローの使用を通して、差次的に発現された遺伝子および経路を決定することができ、それは疾患のメカニズムを理解しそして潜在的なバイオマーカーを見つけるために極めて極めてある。処理された情報では、我々は喘息を同様の条件から検出し区別するための理論的バイオセンサーを設計し、これにより同時に喘息の病因を解読し、そして疾患の診断を改善する。
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CCU Taiwan
Title
Peptide-based dengue virus detection - DENDEX
Abstract
Dengue Feverは、世界保健機関による「トップ10の健康脅威」の1つとしてリストされています。これにより、熱帯および亜熱帯地域で約395億人が脅迫しています。C型レクチンドメインファミリー5メンバーA（CLEC5A）、マクロファージの表面上に位置する受容体は、デングヒューウイルスのエンベロープタンパク質と相互作用し、シグナル伝達を引き起こして生命を脅かすサイトカイン嵐を引き起こす可能性がある。この知識に基づいて、CLEC5Aからの部分配列に基づいてペプチドを使用してデング・ウイルス検出キット「Dendex」を開発しようとしました。まず、ドッキングシミュレーションを用いてこれらのペプチドとエンベロープタンパク質との相互作用を確認した。次に、線形アレイエピトープ（LAE）と呼ばれる新規な技術を用いてこれらのペプチドを製造した。これらのペプチドは、当社のキットにおけるデングヒューウイルスを検出するために使用され、これは指標として金ナノ粒子を含む。このタイプの検出キットが新しい診断的視点を提供することを願っています。
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Baltimore BioCrew
Title
Improving Iron Uptake and Processing in Synechococcus CB0101 to Bolster Marine Ecosystems
Abstract
世界の海の1/3で、鉄濃度は植物プランクトン成長を制限します。鉄は光合成に必要とされ、海洋食品ウェブの底部にとって重要です。鉄を捕獲するより良い能力は、カーボンシンクとして作用することによって大気中の二酸化炭素を還元することのような利点を有する植物プランクトン集団を増加させる可能性がある。私たちは、それが高レベルのCO2を消費し、高い複製率を持ち、多くの前のIGEMチームによって使用されてきたため、Synechococcus（シアノバクテリア）をエンジニアリングすることにしました。私たちのプロジェクトは、シアノバクテリアを細胞に輸送し、それをバイオアベイラブルFe（II）形に減らすように促進します。鉄の利用の増加は、植物プランクトンの光合成および成長を増加させるであろう。有害な植物プランクトンブルームを防ぐために、鉄濃度が大幅に増加した場合、細胞の過剰成長を防ぐために細胞にキルスイッチを添加する。これらの修飾は、海洋食品連鎖を安定させ、大気からCO 2を吸収するであろう。
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DNHS SanDiego CA
Title
PreeclampsiRNA: Degrading sFlt1-14 mRNA with shRNA via lentiviral vectors to treat preeclampsia
Abstract
子癇前症は、妊娠中の高血圧を特徴とする危険な状態です。それは世界的に多くの妊娠に影響を与えます、そしてほとんどの女性はプリカンドリアに生き残っていますが、それは治療されていないそれは重度の合併症、さらには死に続くことができます。広範な研究にもかかわらず、残念ながら、プリカンパ州の信頼できる治療はありません。このプロジェクトの目的は、再結合レンチウイルスベクターを使用して、再結合レンチウイルスベクターを使用して、血清FMS様チロシンキナーゼの翻訳を阻害するために血清芽植物を介して、栄養球の様チロシンキナーゼ（SFLT1-14）、抗血管新生擬似受容体の翻訳を阻害するための効果的な理論的siRNA治療を生成することである。それは胎盤成長因子（PLGF）を捕獲し、それが血管形成のためにシグナルを示す適切な受容体に結合するのを防ぎます。 SFLT1-14の最も効果的な減少を引き起こすのを見るためにいくつかの異なるshRNAシーケンスをテストします。 s11-14のmRNAをsiRNAを用いて分解することにより、この分子の胎盤レベル（これはプリカプチック患者に過剰生産され、高血圧症につながる）を軽減し、したがって症状を軽減することを目指しています。
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Technion-Israel
Title
ACT. Anti-COVID-19 Technology: A hydrogel-based skin-screen containing proteins that act as decoy proteins"
Abstract
SARS-COV-2が、そのスパイクタンパク質（「S」）と私たちの細胞に見られるAce2膜タンパク質との間の結合を通してヒト細胞に入ることが知られている。したがって、これらの「S」を占めることによって、宿主細胞の感染は劇的に減少または完全に遮断され得る。私たちの目標を達成するために、ウイルスの感染能力を低下させる「デコイタンパク質」粒子を含む新規ヒドロゲル系皮膚スクリーンを開発しました。 。当社の製品は何時間も有効になり、肌の微生物を傷つけないため、水で簡単に取り外されます。 「S」を捕捉するために、変異型ACE2（より強い結合に対して操作した）、および/または全抗原結合能を特異的にそれらの「S」に用いる、および/またはシンボー（合成単一ドメインナノボディ）を使用する。両方のタンパク質には2つの送達方向があります：彼のタグ付きタンパク質に強く結合したMicrogelビーズ、およびB球の胞子表面表示技術があります。行為。ウイルス感染のためのさらなる障害を保証する能動的な予防溶液を提供し、したがって曲線を平らにする。
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KSA KOREA
Title
Ligninatior: Biological Lignin Degradation Method for Paper Recycling
Abstract
リグニンの生分解による高品質のリサイクル紙の製造は、既存の紙製造プロセスによって生成された化学副産物および廃水を重大な環境および経済的利益に減少させる可能性がある。リサイクルプロセス中の皮紙および新聞の治療紙および染料脱色ペルオキシダーゼ（DYP）は、明るさ、テクスチャ、および永続性が改善された紙を製造しました。結果は、今日再生紙を製造するために使用される化学治療と比較して、より環境に優しい方法でリサイクル紙を製造するために合成生物学を使用することができることを実証している。さらに、リグニンが溶解したときに生成されるフェノール化合物を検出および測定するためのバイオセンサーおよび蛍光光度計対を開発した。ペアは、紙リサイクルプロセスにおけるリグニン分解の進行を監視し、環境中のフェノール化合物を検出するために使用することができる。大腸菌中でフェノール化合物のトランスポーターを発現させることによって、既存のバイオセンサーと比較して改善された感度を得ることができました。
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AHUT-ZJU-China
Title
carbonic anhydrase 3.0
Abstract
温室効果ガス排出量は、世界の平均気温の増加につながり、それは人間の生活と生活を危険にさらします。安全性、高い触媒効率および環境にやさしい酵素のバイオミメティック法（炭酸アンヒドラーゼ）を使用することを決定した。我々は、好熱性細菌からのCaの触媒性能およびCO 2の捕捉の生物学的安定性を改善することによって効率的で安定なCAを設計した。タンパク質の理想的な突然変異部位を予測するためにコンピュータ支援分析ソフトウェアを使用します。それから我々は酵素 - 基質分子ドッキングおよび酵素溶媒動力学シミュレーション、構築された野生型および変異型Ca原核生物発現ベクターを実施し、そしてタンパク質を発現および精製した。最後に、変異タンパク質の活性が変化したかどうか、そして熱安定性が有意に改善されたかどうかを決定するための機能的同定を実施した。
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Heidelberg
Title
The Legend of Cellda A Link Between Proteins
Abstract
DNA、RNAおよびタンパク質は、合成生物学と人生自体の基本的な構成要素です。それらの全ての融合タンパク質、それはしばしば大きすぎて柔軟性がない、スポットライトを取り、タンパク質工学へのモジュラーアプローチを可能にします。人生の3つの核心の間の相互作用を媒介するために、我々はRNAの力と柔軟性を利用することを目的としています。。さらに、私達は私達のRNAおよびタンパク質を転写産物レベルで再構成するためのトランススプライシングリボザイムをエンジニアリングする。また、特定のRNA結合タンパク質を設計するためのツールを提供するための分子モデリングを適用します。
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NYU Abu Dhabi
Title
Fungal Diagnostics
Abstract
Nyuad IGEMは、迅速でポイントフィールドの真菌診断装置を開発しています。 1900年代半ばから、肉食摂食菌症、チリジオ菌症は、90種以上を拭き取っていて、少なくとも500の減少を引き起こした他の病原体よりも絶滅する水陸両生種を密着させています。同様の真菌性疾患も他に影響を与えていますコウモリなどの動物は、彼らの冬眠を乱し、何百万もの経路に死んだ。スプレッドを管理するための診断の使用は、テスト方法が潜在的、高価、および非ポータブルであるために制限されています。研究および設計での厳密なアプローチの後、プロジェクトの最初の段階は、ビーズ拍動および溶解緩衝液、マイクロ流体および紙ベースのバイオセンサーなどの反応媒体、RPA CRISPR-CAS12Aおよび報告メカニズムなどの反応媒体のプロトタイピングを含む。既存の監視システムと統合することができるデータベースとAPIに加えて、蛍光やLFAなど。
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GunnVistaPingry US
Title
Odigos: An Improved CRISPR-Cas9 Effective Guide RNA Predictor
Abstract
要約：CRISPRIは、ヒト細胞において遺伝子発現を調節するための強力なツールである。目的の標的遺伝子と相同なGRNAを設計することにより、目的の特定の遺伝子の標的ノックダウンを達成することができる。しかしながら、現在の方法論では、オフターゲット効果を最小限に抑えながら、効率的な標的化のために複数のGRNAシーケンスをスクリーニングする必要があります。我々は、ヒト細胞における効率的な遺伝子標的化のための最良のgRNA配列を同定するための予測モデルを提示する。IPS細胞においていくつかのGRNAを使用して特定の遺伝子をノックダウンすることから実験データを開始すると、gRNAのより良い選択を知らせるための機械学習を活用します。私たちのツールはGRNAを標的とする遺伝子を設計するために貴重であり、CRISPR効率を支配する根本的な生化学的原則を明らかにするでしょう。
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CPU CHINA
Title
Prevention methods of alcoholic liver disease by inflammation control and intestinal flora regulation
Abstract
抗炎症性サイトカインIL-22を発現および分泌することができる合成生物を設計し、最初に血流への吸収後の最初のパス効果のために最初に肝臓に到達し、その損傷肝部分をさらなる炎症損傷から保護するための抗炎症機能を実行することができる。。我々はまた、クォーラムセンシングシステムによって制御される抗E.Faecalis関数を用いてChasisを授与した。我々は、e.faecalisに対して高い特異性を有するバクテリオシンJM79、PLWαおよびPLWβを選択し、バクテリオシンはその場で機能して腸内菌のバランスをとるために肝臓をさらなる免疫原性から保護する。塗布されたChasisは、カプセルに経口的に服用することができるプロバイオティックであるE.coli Nissle 1917である。このシステムは、さらなる病理学的進行からのアルコール誘発性炎症を伴う肝臓を保護すると予想され、将来的には補助療法として使用することが可能である。
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BUCT-China
Title
Biodegradation of plastics and further utilization of the degradation products for biopolymer synthesis
Abstract
プラスチックは多くの用途に複数の利点を有する驚くべき物質です。しかし、それはまた私たちの生態環境に大きな災害をもたらしました。時間の経過とともに、プラスチック材料は生分解しないが、マイクロプラスチックとして知られている小さな粒子に分解し、食物連鎖に入る。昨年、我々はPEとPSを劣化させることができる株を観察しました。今年は、昨年の研究に基づいて、私たちはいくつかの改良をし、さらなる探査作業を行いました。私たちのプロジェクトには2つの部分があります。最初の部分はPEをアルカネシンに分解することです。我々は人工代謝経路を構築し、胞子表面にラッカーゼを表現するために表面ディスプレイを使用し、反応をより効率的かつ直感的にする。第二の部分はそれらの代謝産物を使用して環境に優しい材料pHFA（ポリヒドロキシル脂肪酸）を合成することである。ゲノム配列決定および合成生物学に基づいて、我々はPHFAのような合成値添加製品にプラスチックを利用するために別の設計された細菌を構築した。
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JACOXH China
Title
Earthworm Yakult
Abstract
土壌は常に人間にとって重要であり、避難所や食料生産に使用できる資源を提供しています。汚染土壌の防止は、土壌 - 植物動物 - ヒトシステムにおける健康問題に密接に関係しています。ここでは、水銀汚染土壌の検出と修復のための「ウォーキング」生物学的プラットフォームを設計しました。マルチ依存性過敏性スイッチ、水銀モニター、水銀安定剤を用いて多機能化学細菌を培養した。土壌中に水銀イオンが見られると、土壌中に散在している多機能工学細菌を活性化し、発色タンパク質を放出し、低毒性を有するHGSの形態で水銀イオンを安定させることができる。さらに、エンジニアリングバクテリアを土壌中でゆっくり動き、環境の影響を大きく受けていることを考えると、歩行者としてミミズを選択します。エンジニアリング細菌はミミズボディ内に再現され、土壌を通って動かされて、水銀汚染土壌をモニターして治療するためのミミズが移動して移動させます。
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Pittsburgh
Title
Bluetooth Bacteria
Abstract
設計された微生物の機能を制御する能力は、人間の組織内の深さ、作物を囲む根圏、または製造施設のパイプなどの場所に到達するのは難しい内に制限されています。磁気遺伝学の分野は、磁場がどのようにして生体分子および細胞にどのように影響を与える可能性があるかを検討し始めた。私たちのプロジェクトでは、交互の磁場（AMF）の遠隔活性化を介して細菌の機能を制御することを目指しています。大腸菌は、緑色蛍光タンパク質の遺伝子発現を調節するために細胞質温度感受性転写リプレッサーと共に細菌膜の表面に磁性ナノ粒子を結合することによって磁気刺激に応答するように設計されている。 AMF刺激により、磁性ナノ粒子は細胞質温度を上昇させ、それによってリプレッサーダイマーの立体配座変化を誘導し、標的遺伝子の転写を可能にする。この技術は、バクテリアの「無線」制御を可能にするために感熱部品を用いて交流磁場刺激を批判的に結合する。
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UC Davis
Title
Expanding the gene regulatory toolkit in filamentous fungi through bioinformatics-directed genome mining.
Abstract
これらの生物の利用可能な部品リストを拡大するための潜在的な糸状菌の転写因子とその同族結合部位を同定するための計算ツールを開発しました。我々のツールは、生合成遺伝子クラスターおよびそれらの推定的結合部位を同定するためのモチーフの発見アルゴリズムに関連する転写因子のための600を超える真菌ゲノムを採掘するための比較ゲノムアプローチを可能にする。これらの構築物を実験的に検証する必要があるツールを設計しました。これは、転写因子結合部位ペアのライブラリーを作成します。
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RUM-UPRM
Title
Mer-Nite to the Rescue: A Solution to Decrease Contamination in Vieques
Abstract
60年以上にわたり、プエルトリコの島市、島市、ヴィエケが軍事訓練現場として使用されました。材料や爆発物が使用され、生物多様性を壊滅させ、そしてViequensesの健康上のリスクの増加により、汚染の配列が取り残されました。水の水と土壌を清掃するためのイニシアチブが存在する。しかし、それは費用のかかる長いプロセスでした。IGEM RUM-UPRMは、Mer-Niteを提案し、軍事慣行のためにViequesの汚染を減らすためのソリューションを提案します。プロジェクトのフェーズ1は、XPXの存在下で活性化され、XPLAおよびXPLBの発現を通して汚染物質を劣化させる第2の回路と組み合わされた第2の回路と組み合わされた第2の回路と組み合わされた第2の回路と組み合わされる遺伝的システムを設計することからなる。遺伝子MER-NITEは、汚染を減少させ、生物多様性を節約し、そしてViequesでの生活の質を向上させるための代替解決策を表しています。
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SCU-WestChina
Title
Lung Knight- Recombinant protein carried by liposomes for Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Abstract
肺線維症に苦しんでいる世界中の300万人以上の人々がいます。しかしながら、治療効果と標的能力が乏しい主流療法の価格は、ほとんどの患者にとっては高すぎる。この事実に基づいて、我々は完全に新しい治療を提供します.TGF-Beta II切断型受容体をコラーゲン標的ペプチドと融合させて組換えタンパク質薬物を構築した。組換えタンパク質をリポソームに包埋して分子薬物送達システムを構築した。噴霧器を通してそれを吸入することによって肺への薬物は、この製品が3段階実験を通して有効な抗線維症薬であることを証明した。この製品には以下の利点があります。悪化するシグナルを直接遮断し、肺線維症のプロセスを大幅に遅くします。小さな副作用を有する病変を正確に標的としている3。穏やかで効率的な正確なリポソーム送達。患者が自分自身で治療を受けるのに便利にします。
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NOVA LxPortugal
Title
Introducing Pseudomonas putida in the fight against the pine wood nematode Bursaphelenchus xylophilus
Abstract
Pinus Pinasterは地中海地域に固有の樹種であり、松果のある疾患（PWD）、致命的な害虫、洞窟、Bursaphelenchus xylophilusによって引き起こされる致命的な害虫、ポルトガルを含む世界中のいくつかの地域に影響を与えます。この疾患の透過率は、昆虫のベクター、モノコマス属のパインソーヤ甲虫、それがそれらの気管システムの内側とそれらの体表面にB.-キロフィルスを運ぶ。現在、最も使用されている制御方法には、攻撃された木の排除、昆虫のベクトルの成熟摂食を防ぐために殺虫剤を挿入するか、または木から木を噴霧するためのトラップの使用が含まれます。私たちは、松の木のミクロバイオームを導入することによってPWDによる経済的および環境的損傷を防止するために、PWDによる経済的および環境的損傷を防止して、その攻撃の下でのストレス応答によって誘発されたときに殺線虫化合物スパクチナビリンを生産することができる。昆虫のベクトル。
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Harvard
Title
MOTbox: A COVID-19 Antibody Therapeutic Based on Machine Learning and DNA Origami Sequence Delivery
Abstract
Motoboxは、最適化された抗SARS-COV-2抗体を設計し、感染した患者の免疫細胞にそのmRNA配列を提供するために、機械学習とDNA折り紙をカップルするCoviD-19治療薬です。ワクチンが開発されている間に限られたラボアクセスで安価かつ迅速に製造することができるパンデミックシナリオにおける中間治療として継続することを意図しています。アンサンブル機械学習と差動進化アルゴリズムを使用して、結合親和性と治療的可能性を高めるために抗SARS-COV-2抗体配列を最適化しました。インビボで急速抗体産生のために最適化された抗体配列を免疫細胞に選択的に送達するための新規DNA折り紙ナノ構造を設計し、計算的に検証した。最適化された抗体の高効力およびDNA折り紙送達の特異性は最小治療用量を減少させ、それによって処理費用を低減する。私たちの仕事は、他の新興疾患を治療するために拡張することができるCovid-19の迅速で費用対効果の高い抗体治療の概念です。
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UMaryland
Title
A New CDC: Colorimetric Detection of COVID
Abstract
ペースを加速し、Covid-19のテストのアクセシビリティを向上させることは、特に大学の設定において、パンデミックに対する世界の対応にとって重要です。Umaryland Igemは、信頼できる、使いやすく、そして解釈が簡単なローテクCovid-19診断テストを設計しました。湿潤室へのアクセスを欠く、チームは2つのDNAプログラムされた触媒免疫Cas13（DCAS13）認識ドメインを使用する等温CRISPRベースの診断薬を設計しモデル化し、それぞれスプリットベータ - ラクタマーゼの一部に融合した。酵素の再構成に色の変化が起こり、30分後にシグナルが人間の目に見えるという合理的な信頼性で予測します。3つのDCAS13-スプリット - ラクタマーゼORFをクローン化するために、3Aのアセンブリと共に3つの別々のGブロックを使用する。このテストの設計に加えて、UMDの学生の人口を対象としたCovid-19の情報クリアリングハウスWebサイトを展開しました。
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NYMU-Taipei
Title
Off the crown
Abstract
今年のCovid-19の真剣にパンデミックのために、IGEM Nymu-Taipei 2020は、はるかに優れたアプローチで問題に取り組むのが難しくありません。HACE2とSARS-CoV-2のスパイクの強力な結合相互作用の性質を利用することによって、私たちはウイルス進化の利点を享受できると私たちは深く信じています。我々の目標を達成するために、我々は、HACE2受容体結合ドメイン、リンカー、およびスパイクタンパク質を切断するのに特異的なプロテアーゼを含むタンパク質構築物を設計した。タンパク質構築物は捕捉装置として機能し、そして特定の表面上のウイルス粒子の量を捕捉し、破壊し、そしてさえ定量することを意味するように、マスク、コンタクトレンズ、さらには濾過装置などの多くの機会に実施することができる。さらに、SARS-COV-2の数を減らすために、さらに、人間への感染の可能性を低下させる。
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PYMS GZ China
Title
Too Much Infection: general assay platform to test infectivity of current and future SARS-CoV-2 strains
Abstract
伝統的に、SARS-COV-2の感染力を測定するには、深刻なバイオセーフティの懸念を生み出すライブウイルスが必要です。一般的なアッセイシステムを利用して、SARS-COV-2の異なる現在および将来の株の感染力を特定し、潜在的なワクチンの発生防止および耐性を評価するための安全な代替案を作成したかった。異なる株の感染性は、スパイクタンパク質（Sタンパク質）の受容体結合ドメイン（RBD）とそのヒトACE2受容体との結合親和性によって測定することができ、これはウイルスがヒト細胞への侵入を損なうかである。Sタンパク質における様々な遺伝的突然変異は、RBD - ACE2の相互作用に影響を及ぼし、それ故に異なる感染症に寄与する。元のG614D SARS-COV-2株に対応するSタンパク質を発現させ、そして感染性を定量的に測定するためにルシフェラーゼアッセイを使用することによって、この重要な相互作用を再現するための疑似ウイルスを設計しました。
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SEHS-China
Title
Histamine Killer: A system Provides Early Warning and Symptom Relief for Allergy Sufferer
Abstract
干し草、免疫系を侵略し、免疫系を誘発し、組織浮腫を引き起こす主要な物質であるヒスタミンを放出することによって引き起こされる共通のアレルギーは、世界の人口の40％以上が影響を受けていると報告されています。その害を減らすために、SEHS-中国は人々に警告し、早期アレルギー段階でアレルギー症状を和らげることができる生物系を作りました。私たちの主な考えは、皮膚と鼻粘膜の上にヒスタミンレベルが上昇し、症状を軽減するために、ヒスタミンレベルが皮膚と鼻粘膜に上昇し、またRDaO、ヒスタミンオキシダーゼも放出することができる細菌または無細胞系のヒスタミンセンサーを構築することです。このシステムはアレルギーを予防するための薬物として制限されていませんが、食品中の臨床検査やアレルゲンの検出などの他の用途にも利用できます。私たちは、アレルギーの影響を受けやすい人々が将来私たちの製品から非常に恩恵を受けることを願っています。
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KAIT Japan
Title
E. coli that Create a Creative Environment
Abstract
このIGEM Jamboreeでの私たちの目標は「創造的な環境を創造する大腸菌」の開発です。「私たちはすべて大腸菌を培養する不快な臭いを受けました。な々は、生合成芳香族成分を生育する大腸菌の開発によって不快な臭いを作りたいと思いました。芳香族物質として、この研究であるこの研究では、バニリンを生合成する代謝経路で、グルコースをL-フェニルアラニンに代謝し、それをバニラインに代謝するための酵素遺伝子を導入し、バニラのような大腸菌の臭いが不快に軽減するのに役立ちます実験中の臭い、それをもっと楽しくすることができ、あなたがあなたの実験でより創造的になることを可能にします。
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SZ-SHD
Title
Insecticidal Missile: construction of a novel biopesticide using engineered Escherichia coli
Abstract
バッタペストは、多くの地域を襲っている一般的な自然災害であり、それは農業活動を著しく損害し、商業損失をもたらすでしょう。農薬の噴霧によるバッタストの管理は、産業費が高いにもかかわらず広く適用されており、生態学的問題は潜在的に貢献する可能性がある。逆に、BT毒素の研究（Bacillus thuringiensisによって産生される有毒なタンパク質）およびキチノレート酵素の研究は、バッタストに対する期待毒性を示唆した。私たちのプロジェクトでは、この2つのタンパク質を合成するために、紫外線誘導性プロモーターとT4溶解遺伝子を含むプラスミドを「自殺スイッチ」として挿入し、紫外線照射下でこれらの毒素を放出するために自動的に溶解するようにプログラムされた2つの菌株を作成しました。
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UGent Belgium
Title
Vsycle: providing ecological rain on demand
Abstract
干ばつ、水不足、そして洪水は世界的な問題になりつつあります。雲の播種の使用によって降雨量を抑制するために天候に影響を与える特定の粒子が雲で分散されている技術は救済策である可能性があります。雲の播種はすでに実行されていますが、主に毒性沃化銀を使用することによって行われます。チームVSYCLEでは、生物学的、非毒性、生分解性である代替の雲の播種剤を設計しました。このために、我々は氷の形成を促進するPseudomonas Syringaeから氷核形成タンパク質（INP）を使用した。雲における氷晶の形成が多くの環境において重要な役割を果たすにつれて、このタンパク質は雲の播種における沃化銀に代わる潜在的な代替品として使用することが非常に興味深いものであり得る。GMOに関する法律の問題を予測するために、細菌性ゴースト原理に従って細胞内容物を漏らすように誘導することができる大腸菌細胞を生産するINPを設計しました。
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NYC Earthians
Title
Creating A Chimeric APOL3 protein using CRISPR to cure trypanosomiasis in African Cattle
Abstract
寄生キネトプラスティドトリパノソーマブルセイブルセイ（T.Brucei）によって引き起こされたアフリカのトリパノソーマ症は、アフリカの牛の人口を有意に脅かす。トリパノソソーム溶解因子アポリポタンパク質L - 1（Apol1）は、ヒヒ中のあらゆる種類のトリパノソームを殺すことが知られている細孔形成タンパク質である。牛はApol1を欠いているが、ゲノム広い芽から、ヒヒApol1（B - Apol1）の最も近い相同体である牛APOL3（C-Apol3）を発見した。配列アラインメント分析は、C - Apol3がN末端に38残基を欠いており、C末端ドメインに差があったことを示した。さらに、HHPREDおよびRAPTORXを介した構造予測分析は、C - 末端がB - APOL1中の細孔形成電位を最大にするために、N末端がC末端と相互作用し得ることを示したが、C - APOL3はこれらの相互作用を欠いていた。したがって、天然のC - Apol3におけるB - Apol1からのNおよびC-末端の組み合わせを有するキメラタンパク質は、バイオインフォマティクスを用いた機能について設計され研究された。キメラ遺伝子を宿主ゲノムへの挿入および生理学的機能アッセイに挿入するためのCRISPRの能力が実行されている。
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Estonia TUIT
Title
SPARKLE: Solar potentiated Artificially Knitted Lipid Enclosures
Abstract
酵母は細胞工場として使用される可能性があります（バイオディーゼル、高価値脂質など）。しかしながら、細胞に非常にエネルギーがかかるので、生産は化学合成と比較して費用がかかり、製品の抽出は面倒である。競争力を高めるために、メタボリックスイッチのためのインダクタとして、そして電子源として両方の光を使用することによって酵母が高い脂質レベルを蓄積するために酵母を蓄積する。さらに、酵母は製造後に自己溶解するように設計されています。まず、光誘導性プロモーターにより制御される脂質合成酵素の追加コピーを導入します。次に、細胞を光吸収性ナノ粒子で被覆して、細胞がNADPH形成のための電子源として光を使用することができる - 脂質合成のための重要な補因子である。これにより、脂質製造への炭素流束が増加する。生成物の抽出を容易にするために、細胞は、アンカータンパク質を介して細胞壁を標的とする細胞壁分解グルカニゼの誘導によって自己活性化するように設計されている。
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BJ101HS
Title
Mother Yeast
Abstract
私たちのプロジェクトのためのインスピレーションは、看護母親が乳房生産の不十分な不十分な乳児の不全など、乳児の生産や乳児の不便を含む母乳育児の問題に直面しています。フォーミルミルクと母乳の間に有意差があったことを実現しているので、私たちは人間の栄養のニーズに合う母乳代替品を作り出すことを思い付きました。我々は、βカゼイン、κカゼイン、ラクトフェリン、およびα-ラクトアルブミンのような重要なタンパク質の本式乳が存在することを学びました。このようにして、私たちはこれらのタンパク質に注意を払い、合成生物学的方法を使ってそれらを製造することができることを望んだ。私たちは人体の体を歓迎しているので、私たちはエンジニアリングバクテリアとして酵母を選びました。上記のタンパク質を酵母に作製し、それらを培養したCSN2、CSN3、LTF、およびLALBAをトランスフェクトしました。最後に、目標タンパク質を手に入れて製品を作成しました。私たちは、次のようなイギマサーが式乳の欠点を固定するためにアミロースのようなより多くの材料を製造することができることを望みます。
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DeNovocastrians
Title
Engineering microbes to detect and degrade pollutants
Abstract
私たちのプロジェクトを通して、バイオレメディエーションを使用して汚染された環境でベンゼンを除去したいと思っています。伝統的な修復慣行と比較して、バイオレメディエーションはより安いそしてより持続可能である。まず、蛍光タンパク質発現系を介してベンゼンとカテコールの環境レベルを容易に検出および測定するバイオセンサーを作り出しています。次に、当社のプロジェクトは、ベンゼンを自然に輸入する特殊な細菌からのベナブクデ遺伝子クラスター（ベンゼン輸送遺伝子）を特定して分離し、汚染された環境における成長のためにエネルギー中間体に分解する。これに続いて、我々はこれらの遺伝子をプラスミドクローニングベクターに挿入し、そしてモデル実験室種の大腸菌を実質的に有用なベンゼン分解薬に変換して汚染された部位を陸上および水に片付ける。
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OSA
Title
metZyme: A DNAzyme-based Heavy Metal Ion Detection Kit
Abstract
重金属としても知られているリードと水銀のような高密度金属は、環境と私たちの体として著しく害を及ぼしました。毎年、重金属ばく露は世界中の何百万もの障害をもたらします。驚くべきことに、この緊急の問題のための以前の検出方法は、かさばりの楽器や専門の技術者を必要とします。したがって、安価で携帯可能でアクセス可能な正確な検出キットを考案することは私達が差し迫っています。Zn 2+、Mn 2+、Pb 2+と組み合わせるとssDNAを切断することができるDNAZYMEを使用しています。CU2 +。出力を最大化するために、4つの増幅システム（HTDC、トウモットスイッチ、TO-DNA、およびCRISPR-CAS12A）も使用されます。私たちは研究室でこれらの理論をテストしている間、私たちの人間の練習チームは専門家にインタビューし、そのようなキットが水の検出に必要であるだけでなく、私たちのプロジェクトの新しい焦点になる土壌にも発見します。私達は世界中のこの厳しい環境問題の緩和に貢献する重金属イオンの蛍光および横方向の流れ検出を達成しました。
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Stanford
Title
SEED: Self-replicating Embedded Environmental Diagnostic
Abstract
スタンフォードIGEMチームは、Grasグラム陽性菌、枯草菌で行うことができるカスタマイズ可能な核酸診断をエンジニアリングしています。私たちの目標は、B.枯草菌に含まれる自然能力を利用して、持続的な環境核酸監視を創造することです。標的核酸配列細胞の存在下では、2つの検出システムを通して可視シグナルを生成するであろう。第一のアプローチは、標的配列に相補的なRNAヘアピンと、標的の存在下で視覚的な読み出しを生じるレポータータンパク質とからなるRNAのおもちゃを使用しています。第二のアプローチは、相同性の領域に隣接するB枯草菌ゲノム中のネガティブ選択マーカーを除去するために枯草菌の組換えシステムを使用する。このプロジェクトの目的は、セルラーシステムの自然なスケーラビリティを活用することによって、将来のウイルステストの不足を抑えるのに役立つ診断システムを作成することです。
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XHD-ShanDong-China
Title
DisHeat: increase heat adaptability of E. coli by changing the distance between genes
Abstract
大腸菌は、生物産業における最も広く使用されている細菌の1つです。しかしながら、その最適な成長温度（37℃）は最良の活動を示すために慎重に維持される必要があります。大腸菌がより高い温度で耐えることができるならば、それはより効果的であろう。このプロジェクトでは、熱適応遺伝子（DEGP）とその2つのレギュレータ遺伝子（CPXRとRPOE）との間の距離をフィードフォワードループ（FFL）ネットワークモチーフに属する）を変えることによって大腸菌の熱適応性を高めることを試みた。我々の新しいアプローチは、プロモーターおよびプラスミドトランスフェクションの増強などの伝統的な方法に代わるものを提供する。この新しい設計された大腸菌は、反応効率を向上させるだけでなく、特別な使用シナリオ（熱帯地域など）のより多くの要件も満たすことができます。一方、我々はまた、ネットワークモチーフにおける遺伝子の距離と発現との間の関係を調査し、それは合成生物学を基礎的に基づいている。
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BUCT
Title
LegolasMicrocystin: An innovation treatment of algal blooms and microcystin
Abstract
毎年の夏、世界中の多くの湖はいくつかの嫌な緑の微生物で覆われています。それらはシアノバクテリアであり、これはマイクロシスチンのようなシアノバクテリア毒素を生産する。それは脳発熱、皮膚アレルギーを引き起こす可能性があります。腫瘍創世記と肝臓癌を誘発しても、特別なシャーシ - シアノファージを使用しています。我々はファージに2つの部分を添加しようとします：毒素を分解するために使用することができる機能的部分およびシアノファージの放出を妨げる対照部分。私たちの機能的部分はMLR遺伝子クラスターで構成されています。これは、長期的な環状ペプチドを無害なアミノ酸に分解するためにミクロシスチン-LR分解酵素を生成します。私たちの管理部分は非天然アミノ酸系で構成されています。それはシアノファージの増殖を制限するために使用され得る。設計された組換えシアノバクテリアを水域に入れることで、これが藻類の咲きや毒素の劣化におけるより安全で効果的な治療法になることを願っています。
[Go to Wiki](https://2020.igem.org/Team:BUCT)
Montpellier
Title
Phagent: Phage-mediated reprogramming of the tumor microbiome to fight cancer
Abstract
Phagentは、腫瘍微生物の細菌およびファージの細菌を含む癌に対する世界的なアプローチです。私たちの目標は、腫瘍の微生物をハッキングし、感染した細菌を腫瘍溶解性分子を産生させるファージを設計することです。我々は、CGASスティング経路、腫瘍抑制経路、および免疫系と相互作用するナノボディを妨害する、CGASスティング経路を誘発するDACAに焦点を当てた。ファージを腫瘍に注入し、そしてミクロビオームの細菌を形質転換する。ファージの選択は標的癌およびその微生物性に依存する。次に、細菌は癌細胞を妨害し、アポトーシスを引き起こす治療用タンパク質を生産する。Phagentは、いくつかの種類の腫瘍と戦うのに効果がないかもしれない古典的な治療を補完するでしょう。
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UGent2 Belgium
Title
Bubbly: an edible pearl for intestinal microbiome modulation
Abstract
世界中で3億人以上の人々がうつ病に苦しんでいると推定する人。研究は、腸微生物の変化が人のストレス反応性において重要な役割を果たし、不安のような揺れのような挙動に影響を与えることを示した。簡単に言えば、私達が腸の微生物の機能を変えることができれば、双方向コミュニケーションはシフトし、不安やうつ病のような行動を引き継ぎます。私たちは、陽気にうつ病を元に戻し、うつ病に苦しんでいる人々に安心をもたらすことができると私たちは信じています。私たちの真珠、新規な栄養補助食品は、抗炎症性、コジボース、腸のミクロビオームおよびビタミン-b12に有益な効果を伴う植物的な糖を作用する、ナリンジニン、フラボノイドの3つの主要な成分から構成されています。今、私たちはラボでナリンニンを製造し、真珠の製剤に取り組んでいます。私たちの真珠は独立した製品として販売することができ、プロバイオティクスとして既存の食品に追加することもできます。
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FSU
Title
SPLASH: Sewage Purification Limiting Antibiotic Spread in Habitats
Abstract
抗生物質耐性は世界的な緊急事態の増加です。微生物は、米国で280万人の感染を低下させ、毎年米国で280万人の死亡を有効にしないように微生物を進化させ続けています。フロリダでは、イルカはセンチネル種として役立ちます。インド川のラグーンのイルカの縦断的研究は、細菌分離株の88.2％が少なくとも1つの抗生物質に対して耐性があることを見出した。エリスロマイシンに対する耐性は全ての細菌のうち91.6％の中で最も高かった。抗生物質は、畜産と抗生物質の処分を通して私たちの環境に入っています。我々はEREAおよびEREB酵素を発現する操作された大腸菌を設計しました。これは、廃水処理植物の二次部分にエリスロマイシンと、操作された細胞が脱出するのを防ぐことを目的とした遺伝的系となります。私たちのプロジェクトは、抗生物質耐性の急速な広がりを抑えるために世界中の水処理植物に実装することができます。
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ECNUAS
Title
Development of an Experimental Platform for Screening GR antagonist against T2DM
Abstract
T2DMは、β細胞機能障害およびインスリン抵抗性によって引き起こされる相対的なインスリン欠損によって特徴付けられる。肝グルコース代謝はグルココルチコイドによって調節され、グルココルチコイドの効果は通常グルココルチコイド受容体（Gr）によって媒介される。グルココルチコイドの増加は血糖値を悪化させる副作用を有する、そしてGRアンタゴニストは血糖値を改善することが報告されている。したがって、GRアンタゴニストをスクリーニングするためのプラットフォームを確立することが重要です。我々の研究では、GR上の薬物の拮抗作用を検証するために、GRトランス活性化アッセイが確立される。GRアゴニストとしてのデキサメタゾン（DEX）はレポーター遺伝子発現を効率的に活性化し、そしてGRアンタゴニストとしてのミフェプリストンはDEX誘発レポーター遺伝子刺激に拮抗する。私たちの実験の成功は、GR関連の薬の研究を後押しします。
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まとめ
いかがでしたでしょうか？
大変多くのチームが、オリジナリティ溢れたプロジェクトを行っていることがわかっていただけたかと思います。本記事では、iGEM2020に出場したチームの1/4ほどのチームしかとりあげられておりません。さらに興味をもっていただいた方は、その他のバージョンも参考にしていただけたらと思います。
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