本記事では、iGEM 2020年に参加した全チームのプロジェクトについてまとめた記事の第一弾の翻訳版になります。(全4回を予定しています)。
iGEM 2020では、どのようなテーマがあったのか網羅的にわかるようになっておりますので、ざっと眺めて見てはいかがでしょうか。
公式版はこちらから
iGEM2020全チームプロジェクト概要 ~第一弾~
※Google 翻訳を利用しているため、一部翻訳がおかしな部分が存在する可能性があります。そのような記載を発見された場合、該当箇所についてご連絡いただけると助かります。
[翻訳版] iGEM2020全チームプロジェクト概要 ~第一弾~
データの見方
(例) チーム名(チームページリンク付き)
タイトル
要約
Wikiへのリンク
このような構成で、全チームをまとめていきます。
チームリスト
OUC-China
Title
Logitch: Logic Gates and RNA Switch
Abstract
将来的には、ウイルスの検出やin vivoの健康の監視など、より多くの作業をコンピュータで行う必要があります。そのような機能は、湿式環境で作業する生物学的コンピュータによってのみ達成することができ、これは伝統的なコンピュータが置き換えられない重要な役割を果たす重要な役割を果たしている。電子コンピュータの基本関数ユニットは論理ゲートを通して実装されているので、毒物と3WJのリプレッサーによって構築された一連の論理ゲートを組み込んでおり、そして私たち自身の設計でタイプの現在のタイプの欠如を補完しました。基本論理ゲートを使用して、より複雑なマルチ入力ロジックゲートも作成しました。これらの論理ゲートの広いアプリケーションの展望を示すために、我々はそれらを加算器と減算器の建設、およびウイルス検出で使用した。BIOCOMPUTERは今後数年間でさまざまな可能性を持つ可能性があり、プロジェクトが開発に影響を与えることができることを願っています。
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BNDS_China
Title
BACLOTH
Abstract
野生動物の革師は衣料品やファッション業界に大きな価値を持っています。ワニバッグのようないくつかの高級製品は希少種から革を必要としています。この有益な事業は、任意の野生動物を違法に狩猟し、傷つけるように派手を運転します。革の要求は野生動物を危険な場所に置き、種の保全のための密猟によって引き起こされる害は考えられない。そのため、動物の保存のための人工皮革を製造するために細菌セルロースとタンパク質架橋を統合することを目的としました。具体的には、細菌セルロースを合成するためにG.キシリン菌を利用した。また、タンパク質架橋についてSpycatcher003とSpytag003を用いてコラーゲン様タンパク質とスパイダーフィブロインを精製するために、大腸菌およびP. pastorisを設計しました。この合成生物学的方法は、動物や環境の会話を確実にする一方で、革業の原材料を供給する代替方法を提供します。
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XJTU-China
Title
Sand Fixers Alliance
Abstract
過度の森林伐採、放牧および人間の放牧、砂漠化が強化されました。天然の砂定着システム、生物学的な土壌の地殻が砂漠化のために戦うことが発見されました。しかし、この自然な砂の固定戦略は常に攻撃的な砂に直面するときにはほとんど効果がありません。したがって、我々のプロジェクトでは、主要な酵素GaluおよびPGMの異なる組み合わせを導入することを介して、細胞外多糖類、土壌皮の重要な成分を効果的に製造するために設計された枯草菌を構築した。アラビノース調節された自殺スイッチはまた、設計された細菌がバイオセーフティのために砂漠環境から解放されると自殺を開始するために構築された。さらに、砂漠化のために戦って砂定着同盟を形成するために枯草菌およびシアノバクテリアの研究開発システムが開発された。私たちのプロジェクトは、現在の状況、危険、砂漠化の解決策、そして砂漠化管理のためのより便利で効果的な戦略を提供することを約束することを約束します。
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XMU-China
Title
Antea-Glyphosate
Abstract
お茶は中国文化に深く根ざしています。長期間、大量のグリホサートが除草剤として使用されてきました。これは茶食品中の残留農薬の重度の問題を引き起こします。XMU-中国は、効率的なグリホサート検出および劣化システムの開発を目的としています。検出システムでは、グリホサートはいくつかの酵素によって分解され、次いでNADPHによって引き起こされる測定可能な蛍光シグナルに移される。そして、劣化システムは、毒性を最小限に抑えるためにグリホサートをAMPAにすることを崩壊させることを計画している。異なる誘導物質によって制御される2つの自殺スイッチも投影されています。このプロジェクトは農薬残基の検出と劣化のための新しいアイデアを提供することができることを望んでいます。小さな細菌による地球の世話をすると、私たちはここでお茶のより良い未来を約束します。
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SCUT_China
Title
LyDT Phage
Abstract
このプロジェクトでは、溶解性P.緑膿菌ファージVB_PAEM_SCUT-S1（S1）のゲノム中の特定の遺伝子が、最初のプラスミドが発現する2-プラスミドシステムに基づくCRISPR-CAS編集戦略によって設計され得ることを示しています。CANヌクレアーゼおよびリコンビナーゼ（λ-赤）、第2のプラスミドは、CRRNAカセットおよび修復テンプレートを抱いている。簡単に説明すると、抗菌毒素除菌を発現する溶解欠損ファージ変異体（LYDT S1）を構築した。変異体は、ホルニンの遺伝子、溶解促進ファージ毒素をRELE遺伝子と交換することによって得られ、これは依然として除細菌の発現を通して細菌の増殖を阻害することができるが、Holin遺伝子が排除されるので細胞溶解を誘発することはできない。これは、細菌から放出されるエンドトキシンの量を減少させると予想され、細菌感染の間の全身性サイトカイン応答および炎症の低下を伴う。
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[NJU-China
Title
ExosomeBomb SiRNA
Abstract
siRNAは、mRNAを特異的に標的とし、癌治療を促進することができる治療標的の発現を調節する機会を提供する。ここでは、外因性siRNAの自己集合を分泌エキソソームに直接向けるために、肝臓を組織シャーシとして使用した合成可能なプログラマブルな遺伝的回路を設計しました。回路は、癌細胞を阻害するだけでなく、免疫系を回避するために偽装癌の使用を除去するためのSiRNAを発現するコア部品を含む。より多くの抗癌エキソソームの産生を促進し、エキソソームを標的とするガイダンス部品を促進した。一緒になった、遺伝部は抗腫瘍エキソソームに組み立てられ、循環中に分泌され、癌細胞に送達されそしてそれらを排除する。この戦略は、生物医学における幅広い問題に対処できる個別化された治療戦略を提供することさえできる制御可能で効率的で便利な癌治療を提供した。
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USTC-Software
Title
Protein molecular simulation toolchain
Abstract
PYDTIのようないくつかの分子シミュレーションソフトウェアツールを収集し、使いやすいWebプラットフォームを構築し、分子シミュレーションツールチェーンを提供し、これらの古典的な分子シミュレーションツールと現在のクラウドプラットフォームを組み合わせる可能性を見つけることができます。私たちのプラットフォームが特定のものではなく、多くの研究者に役立つことを可能にするために、コンテナーと分散計算などの技術。
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Hannover
Title
InToSens Development of an Inflammatory Toxin Sensor for detecting implant associated inflammations
Abstract
インプラントの配置は、世界中の病院で最も頻繁に実行される操作の1つであり、まだ数が増えています。残念ながら、そのような手術後にインプラント関連炎症を発症する危険性は非常に高い。インプラント関連炎症の起源は、しばしばバイオフィルムであり、これはインプラント表面に取り付けられている。そのような細菌バイオフィルムの標的治療は困難である。抗生物質による典型的な治療的アプローチはしばしば失敗する。最悪の場合、地域の寛大な除去は必須です。したがって、初期段階でバイオフィルムの形成を検出することは有用であり、成功した治療の可能性を高めます。私たちのプロジェクトはこれを可能にするセンサーを開発することを目的としています。センサーは遺伝子操作された細胞によって実現され、それは細菌毒素を認識しそして反応としてバイオマーカーを生成することができる。開発を通して、私たちは社会的および倫理的側面と併せてさまざまな観点からプロジェクトを調べました。
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UTTyler
Title
Diagnosis of viral infections using photonics and biomolecular techniques
Abstract
ウイルス疾患は、媒介因子が依然として浮遊感染症を介してこれらの病原体を依然として広げることができるが、穏やかな症状を有する長いインキュベーション期間が一般的である。これらの特性は、これらの疾患の広がりを予防する際の重要な課題につながります。潜在的に、集団全体の日常的な診断は、伝送をブロックするためのすべてのウイルスキャリアを識別することができる。しかし、ほとんどの診断方法には高度な機器やスキルが必要で、社会におけるすべての個人を頻繁に検査することが困難です。この問題に対処するために、ユーザーが毎日自宅でテストを実行できるようにする診断プラットフォームを開発することを提案します。我々のアプローチは、ウイルスゲノムを認識し、そして我々のプローブとウイルスDNAとの間の関連を監視するためのフォトニクス技術を使用するためのプローブを生成するための細胞技術を使用することを含む。テストは短期間に過ぎず、すべてのユーザーによって簡単に実行できます。
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Manchester
Title
HippoSol The sunscreen for the future
Abstract
定期的に保護されていない太陽への曝露は、皮膚がんを含む複数の皮膚疾患をもたらす可能性があります。皮膚癌はイギリスの5番目に一般的な種類の癌であり、それでも60％の症例が予防可能です。したがって、日焼け止めは使用することが重要ですが、海で泳いで使用されている場合、従来の日焼け止め成分はサンゴ礁に酸化的ストレスを引き起こし、深刻なサンゴの漂白をもたらします。私たちのチームは、この問題に対処するために新規の無毒性の、殺菌性、哺乳動物由来の広いスペクトルUVフィルターを製造することを目指しています。我々の目的化合物は、環境効果を最小にする未反応分子に自然に重合する。私たちの目標は、市販の日焼け止め剤のためのリーフの安全な代替手段として、細菌の新規の日焼け止めを作り出すことです。革新的な後退方法を使用して、私たちの製品が安全で責任のある方法で緊急の現実的な必要性を満たすように、起業家精神、ステークホルダーエンゲージメント、およびメディア分析のようなテクニックを活用します。
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Nanjing-China
Title
PolyP Pro
Abstract
製造工程における汚染や安全上のリスクなど、合成化学材料には多くの問題があります。合成生物学によって、生体分子の元の機能を維持するだけでなく、その化学物質を最適化するだけでなく、生体分子タンパク質を用いて、化学に一般的に使用されている無機材料ポリリン酸塩を生合成することを望みます。プロパティ。
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Leiden
Title
Rapidemic: A novel modular point-of-care diagnostic tool for rapid epidemic response
Abstract
今年のCovid-19の発生は、世界がパンデミックによってどのように影響を与え、世界中で100万人以上の死亡を引き起こし、10億人の生活の質を著しく損害しています。迅速な診断は、制御下で発生を保つために不可欠であり、措置を中断する必要性を減らすことができます。ここでは、将来の発生における病原性種の核酸の急速な検出を可能にする急速血症と呼ばれる革新的なモジュラー技術を提示します。標的増幅（RPA）、ニッキーゼベースのGQ DNAZYME生成（LSDA）、およびDNAザイム触媒酸化を組み合わせることによって、我々の方法は確実に病原性DNAまたはRNAを迅速に検出し、そしてユーザに単純な比色出力を提供する。実験室や外部の電源が必要ないため、当社の技術は高リソース分野と低資源分野の両方でポイントオブケアテストを可能にします。このようにして、急速血症は世界的な問題に対する世界的な解決策を提供し、私たちが病気のXに取り組むのに一歩先になることを可能にします！
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Rochester
Title
Creation of a Novel, Noninvasive Diagnostic for Endometriosis using Menstrual Effluent
Abstract
2020年のロチェスターIGEMチーム、チームの子宮は、月経排水（ME）を使用して子宮内膜症のための小説、非侵襲的な診断を開発しました。子宮内膜症は慢性疾患であり、世界中の2百万人の女性は子宮腔の外側で異常な子宮内膜状の組織成長を引き起こす。利用可能な唯一の診断は探索的な手術です。我々のチームは、私の中の子宮内膜症バイオマーカーの存在を定性的かつ定量的に測定し、そしてアッセイ設計を最適化するためのモデルを構築することができる外側フローイムノアッセイ（LFA）を作成しました。プラグアンドプレイアプローチを使用して、私たちのチームはシャッフルステイン大腸菌の抗体産生のプラスミドを設計し、私たちの診断のコストを削減しました。さらに、実験室アクセスなしの診療所のための安価な検査装置の快適性に最適な月経カップを創造しました。私たちのチームはまた、臨床変数のみに基づく子宮内膜診断診断としてソフトウェアツールに統合された予測モデルを構築しました。
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USAFA
Title
Detection and Degradation of Perfluoroalkyl Substances through Bioengineering
Abstract
ポリフルオロアルキル物質（PFAS）は、公共の地面と地表の水を汚染し、野生生物や人間の健康に深刻な脅威をもたらします。これらの化合物のユビキタス的な性質にもかかわらず、これらの化学物質を検出し分解するのに限られた技術が限られています。この緊急の必要性に対処するために、米国の空軍アカデミーIGEMチームは、PFASの迅速な検出のための効率的なバイアレ輸送者として機能するための新しいPFAS応答プロモーターを設計しました。同時に、チームはPFASを積んだ土壌サンプルをスクリーニングし、高濃度のPFAで生き残ったいくつかの微生物を特定した。 Delftia Accidovoransは、特定された微生物の1つが、PFAS化合物を分解するための潜在的な活性を有するいくつかの脱ハロゲナーゼの遺伝子を含む。脱ハロゲナーゼ発現のための代替ベクターおよび生物は、PFAS炭素 - フッ素骨格からのフッ素イオンを除去するのに最大効率を決定するために探求されている。水処理専門家と軍事研究室との協力は、PFAS問題に対する多面的な攻撃を提供します。
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Lethbridge_HS
Title
tPectinACE: Targeting Pectin to Accelerate Compost Enzymatically
Abstract
埋立地は成長しており、この埋め立て地を占めるアイテムの大部分は食料廃棄物です。食品廃棄物が埋め立て地に入ると、さまざまな環境影響があります。これは、私たちの食品の生産中に豊富な温室効果ガスが排出されるものです。さらに、食品出荷は船積材とプラスチックを利用して、環境を大幅に害に害します。食品廃棄物処理サービスが利用可能であるが、それらはメタンを放出し、経済的に生産的ではない。さらに、堆肥化施設は、食品廃棄物の問題と闘うのを助けていますが、容易に入手または宣伝されていないことがあります。いくつかは家庭用堆肥化にアクセスすることができますが、これは食品廃棄物を軽減する非効率的な方法であり、害虫を引き付ける可能性があります。したがって、我々は、密閉容器内の食品廃棄物を破壊し、動物を維持し、そして化学物質を環境に入らないようにする、設計された生物学的触媒を採用するシステムを提案する。
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NEFU_China
Title
Bio-optical Landmine Detection
Abstract
現在、少なくとも110万人の地雷が世界中の分野に埋められています。これらの土地は、毎年何万人もの人の死傷者だけでなく、深刻な環境汚染もあります。貧困者が迅速かつ安全な方法で土地を検知するのを助けるために、私たちのチームはバイオ光学的な地雷検出装置を設計しました。私たちは、土壌によって放出された典型的な化学物質であるジニトロトルエン（DNT）を感知するために遺伝子回路を保有する大腸菌株を設計しました。DNTは、当社の設計された細菌における生物発光生成モジュールをトリガーすることができ、発見された光信号をキャプチャして装置によってデジタル出力に変換することができ、これはオンサイトコンピュータにアップロードされる。データ処理を通じて、特定の分野で地雷の確率論的なヒートマップを作成することができます。最終的には、最適化された土地のクリアランス経路を、脱地力のある損傷の最小限のリスクを伴う手動ランドミン検出を支援することが提案され得る。
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NWU-CHINA-A
Title
Avenger assemble
Abstract
重度の副作用のリスクと抗生物質の潜在的な耐性のリスクの増加は、それらの使用法を制限しています。さらに、非生分解性医療製品負荷抗生物質は世界的な汚染の1つです。これらの問題を解決するために、私達のチームは、微生物からの新規のヒトデフンシン（HBD）およびポリヒドロキシアルカノエート（PHA）に基づく医療用包帯を設計することを目的とした。薬物耐性および免疫原性のない優れた血液相溶性および効果的な抗菌性を有するヒトからの新規な抗菌ペプチド（AMP）のHBDS。 in vitroで柔軟なPHAフィルムの表面上のHBDを組み合わせるために、天然のPHA表面結合タンパク質（PHAP）を用いて融合タンパク質を構築した。 HBDS、PHAおよびPHAPを含む完全生分解性医療用包帯のすべての部分は、エンジニアリング細菌で設計され製造されています。 HBDSとPHAの組み合わせが持続的な抗菌性および接着剤包帯の組織適合性を高めることができることを願っています。その上、医療分野への概念を実装することは私たちの将来の仕事です。
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TAS_Taipei
Title
Viral Spiral: An Accurate, Fast and Simple Viral Diagnostic Test
Abstract
何百万もの感染症と数百人の死亡を占める季節性インフルエンザおよびパンデミックは、予防的および治療的措置を実行するために迅速かつ信頼性の高い検出メカニズムを必要とします。ウイルス感染の現在の検出方法は、速度、精度、アクセシビリティ、そして使いやすさの制限を有する。このプロジェクトは、常に密集した直接RNAを標的化し、比色および室温で動作可能であるように、修正されたローリングサークル増幅（RCA）を使用する新規で広く適用可能なウイルス診断検査を提示する。我々は特に以下の高負荷ウイルスを検出している：SARS - COV - 2、インフルエンザA（H1N1PDM09）、およびインフルエンザB（ビクトリア系統）は、我々の試験はあらゆるウイルス感染に適合させることができる。合成ウイルスDNAおよびRNA配列を用いた結果は、当社の診断試験が約1時間かかり、フェムトモル濃度のRNA鎖を検出し、そしてウイルス株の間で分化することを示している。私たちの診断テストを実施すると私たちは社会的回復の迅速な将来のウイルス関連の発生に対するより速い応答を提供すると考えています。
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UiOslo_Norway
Title
Sal.Coli - A detection system and approach for treating amoebic gill disease
Abstract
養殖産業が顔を養うことが魚の疾患の検出と治療の両方で革新を必要とする生物学的および環境的な懸念。これらの中には、大西洋サーモンに影響を与える扁桃体ペルーランによって引き起こされたアメービックジル病があります。Paramoeba Peruransは、サーモンのギルの上にラッチし、鰓のある呼吸表面積を減らすことによって不快感と死を引き起こします。私たちのプロジェクトは自動検出システムを作成することを目的としています。このシステムを作成するために、集合的な行動を調査しています。そして、それらを使用して病気を診断することができる方法を調査しています。我々はまた、遺伝子改変大腸菌を使用してサリノマイシン、抗副性化合物を製造することを目的としている。サリノマイシン産生の遺伝子クラスターは、この化合物の製造への代替経路を提供することを目的として、段階的に大腸菌段階に移されるであろう。私たちのシステムが今日の養殖養殖で使用されている現在の診断ツールと治療を補完することを願っています。
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DUT_China
Title
Reboot T4
Abstract
病原性細菌の抗生物質耐性を高めると、我々は抗生物質のない抗生物質に入っています。ファージ療法は、病原性細菌と闘うための有望な戦略の1つです。合成生物学は、ファージ療法に適した所望の特性を有する天然のファージをエンジニアリングすることを可能にする。ここでは、168.9kbpサイズのゲノムが既存の方法論を通して操作するのに大きすぎるColiphage T4を遺伝的に操作して再起動するための酵母ベースのプラットフォームを開発しています。T4ゲノム全体は、重複延長PCR、酵母変換関連アセンブリ、およびCRISPR / Cas9促進相同組換えアセンブリを介して階層的に増幅および組み立てられる。次いで再構成されたT4ゲノムを大腸菌にエレクトロポレーションしてファージ粒子を生成する。私達は私達のプラットフォームが大型のゲノムを持つ巨大なファージの操作に適していることを期待しています。
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Nottingham
Title
NeuroTone: The microbiome and neurodegeneration
Abstract
ノッティンガムIGEMチーム大学は、合成生物学を用いて神経変性疾患の発症と進行を遅らせるための新規なバイオサーチックを開発してきました。細菌クロストリジウム胞子をエンジニアリングすることにより、ケトンD-β-ヒドロキシブチレート（DBHB）を分泌するために、脳内の酸化ストレスのケトン媒介緩和による神経保護を達成する。これは、確立された培養物が血流に入り、腸脳軸を利用して血流の障壁を交差させる腸内胞子の送達によって起こります。数学的モデリングを使用して、我々は微生物DBHB産生を支持するための経路を同定し、培養サイズと代謝活性をどのように調節できるかを調べた。遺伝的に修飾された生物に関する潜在的な懸念を認識して、私たちは私たちのバイオサーチーチックが環境に逃げることができないように厳格なコントロールを設計しました。主要な利害関係者との協議に沿っていくつかのアウトリーチプロジェクトを通じて、私たちはより広いコミュニティに従事し、私たちの作品を知らせて形作りました。
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MichiganState
Title
BeeTox
Abstract
2005年以来、蜂の人口は驚くべき率で減少しています。私たちのチームは、これらの死に貢献する1つの主な要因に対処することを決定しました：農薬。 Project Beetoxは、蜂がイミダクロプリド、一般的なネオニコチノイド農薬を解毒することを可能にするプロバイオティックです。プロジェクトのさまざまな側面に対処するために、3つのサブチームに分けました。デバイスチームは、画像認識バイオコンフェテインメンテンメカニズムを組み込んだプロバイオティクスを砂糖水に投与するためのフィーダーを設計しました。遺伝子エンジニアリングチームは、蜂の腸を植民地化する微生物であり、効果的に形質転換することができる微生物であるSnodgrassella Alviのデザイナー株を作り出すように働いた。イミダクロプリドを解毒するための輸出酵素に対するS. AlvIのタイプI分泌システムの修飾に向けられた私たちの努力は指向されました。バイオインフォマティクスチームは、計算的にイミダクロプリド分解酵素をモデル化し、イミダクロプリド分解の代謝プロファイルを分析した。このテクノロジの実装の成功は、無数の蜂と彼らが受注する植物を節約する可能性があります。
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SZU-China
Title
Blueism - A novel eco-friendly scheme for jeans dyeing and washing
Abstract
すべてのトンのジーンズを製造すると、排出された2500の有毒化学物質が200トンの水を汚染し、環境に壊滅的な影響を与えます。さらに悪いことは、強い腐食性化学試薬やサンドブラストなどのジーンズの擦り傷やサンドブラストなどの伝統的な方法の使用を引き起こします。今年私たちはジーンズ工場のための環境にやさしい効率的なシステムを設計しました。私達のシステムは2つの部分を含みます。最初の部分では、染色効率の高い環境に優しい顔料を含むGardenia Blue、環境に優しい顔料を合成するために、組換え大腸菌を介して熱安定性β-グルコシダーゼを製造しました。染色後、我々は石膏洗浄工程の置き換えにおいて擦り切れのために組換えセルラーゼ（エンドグルカナーゼ）を使用した。その上、私達は私達の製品をジーンズの製造プロセスに調整するためのハードウェアを設計しました。手短に言えば、私達の自動グリーンシステムは汚染を減らし、労働者の健康を保護しながら、手動の染色と擦り傷プロセスを置き換えることができます。
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Hamburg
Title
Unicorn - an aMAIZEing concept
Abstract
合成生物学者は、シリコでよく機能するが、適用で予期しない効果を有するファンシー合成回路を想像している。多くの場合、私たちはすべての複雑な細胞に合成制御器具（例えばプロモーター）を追加して、すべてが細胞文脈でさえ計画通りに働くことを願っています。しかし、この追加の複雑さは、規制プロセスとの相互作用が未知のために問題を引き起こす可能性があります。私たちの目的は合成遺伝子管理をより簡単にすることです。細胞は病原菌感染症のように、外部刺激に対する特異的応答を有する。我々は、天然細胞応答を標的出力の信頼性の高い発現と結合する新しいメカニズムを提案し、合成遺伝子制御をより豊かで複雑で複製することができない。大腸菌、Zea MaysとArabidopsis Thalianaの概念の証明後、私たちの普遍的に適用可能な方法を作物植物に持続可能な病原体と疾患抵抗を生み出すために使用されることを願っています。
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Concordia-Montreal
Title
AstroBio, open-source database for gene expression in microgravity & AstroYeast, resistant strains to microgravity-induced stress
Abstract
細胞農業を含む合成生物学の進歩は、地球上の食品の持続可能な生産を可能にします。しかしながら、長期間のバイオリアクターの培養が不可欠である宇宙生成物内生成剤は、困難であることが証明されている。微小重力は、遺伝子発現プロファイルの世界的な変化を誘発し、細胞における応力反応を誘発する。例えば、Saccharomyces cerevisiaeは、細胞の成長と生産性に影響を与える異常な細胞極性、出芽、および分離によって特徴付けられるストレス応答を示します。微小重力研究者のためのバイオインフォマティクスツールの欠如もあります。このギャップを埋めるために、私達は微小活性誘発性遺伝子発現の変化に関する文学的発見を異なるモデル生物における異なるモデル生物の変化に関する文学的発見を整理した。このデータベースは、微小重力誘起ストレスに耐性のある宇宙飛んでいる酵母菌株の開発を知らせます。これは、ひずみ適応進化、またはゲノム全体の過剰発現とノックダウンスクリーンのいずれかによって、ハイスループットの方法で行われます。宇宙飛行は、微小重力条件下で宇宙で栄養素を持続的かつ再生可能に産生するために使用することができる。
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BotchanLabTokyo
Title
nico-friendly
Abstract
毎年約4.5兆タバコ吸着が環境のどこかに預けられます。毎年沿岸の清掃によって収集された廃棄物のうち、タバコ吸虫はこれの最大の割合であり、これはカウントによって総廃棄物の約19~38％を占めています。タバコ吸引源からのニコチンは海洋環境に悪影響を及ぼす。Pseudomonas Putida S16はニコチンを代謝することができます。この経路を大腸菌に導入することを計画しています。大腸菌がニコチンを劣化させる能力を得ることを期待しています。経路を介して、ニコチンは2,5-ジヒドロキシピリジンに変更される。2,5-ジヒドロキシピリジンは、肥料と医薬品の主な材料である5-アミノレブリン酸の前駆体です。私たちのプロジェクトがタバコを捨てるのをやめるのを助けてくれることを願っています。そして、生き物がより安全かつ平和的にあることを願っています。
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SJTU-BioX-Shanghai
Title
LUCAS: Locational Unique Cas9
Abstract
CRISPR技術のオフタイト問題は、そのインビボ操作にとって最も面倒な要素です。これに関して、私たちのプロジェクトは、特定の目標のためのCRISPR-CAS9システムを高精度に得るための最適化方法を実施しました。この目標を達成するために、我々は指向型進化と合理的な設計方法を採用しました。オフターターゲット予測でパイプライン統合機学習とマルコフプロセスを提案しました。一方、分子動力学およびグラフ理論はまた、指示型進化および合理的設計を導入および解釈するために適用された。実験では、転写活性化および抑制回路は、スクリーニングおよび報告プロセスのための指標として機能するオン/オフターゲットレートを反映するように構築された。最後に、私たちの方法がさらなるアプリケーションのためのガイダンスになることができることを願っています。
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AshesiGhana
Title
The Coastbusters: Saving the Coast One bottle at the time
Abstract
毎年、800万トン以上のプラスチック廃棄物が海に捨てられ、海洋生態系を傷つけますか。それに応答して、海は沿岸侵食を通して跳ね返っているようです、それは世界中の人間の集落を脅かしています。バイオレメディエーションいくつかのプラスミドはプラスチックを崩壊させ、バイオセメンテーションプロセスを実行するための設計であり、そしていくつかのプラスミドは構成的プロモーターの下で遺伝子を有するであろう。他のものは、生態系に最適なpHを維持するためのpH応答性プロモーターの下でそれを存在させながら、テトラポッドの亀裂の起こりのために増加した光の存在下で活性化されるであろう。私たちは、生態系を開始するため、そしてそれを自己平衡させるために必要な条件を特定することを目指しています。
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Tsinghua
Title
NO mediated Biofilm Allayer(NBA)
Abstract
バイオフィルムと呼ばれる複合細菌群集の形成は、産業分野の両方で重要な事象であることが証明されています。一般的な機会病原体としてのP.Aeruginosaは、抗生物質および消毒剤を回避することを可能にするパイプライン上に耐性のあるバイオフリムを形成することができる。真核生物および原核生物の両方の有意なシグナル分子である二原子ガス（NO）は、Pα= aeruginosaにおけるバイオフィルムの形成を調節することが実証されている。ここでは、このプロジェクトではE.coliを設計しました。このプロジェクトでは、CoudldがP.Aeruginosaの存在をVia Leved Rhlクォーラムセンシング（QS）システムの存在を感知し、NOS遺伝子の合成とNOの生産を誘発し、最終的にその結果バイオフィルム分散ガスや化学ドナーと比較して、当社の設計された細菌は、より優れた効率とコストでバイオフィルムを分解するための別の解決策を提供します。
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NCTU_Formosa
Title
E. Hybrid
Abstract
貴重な分子およびタンパク質の製造における大規模な生合成は、より持続可能で再生可能な製造方法のためにその胚性段階に入ってきて、そして同時に生物工学において複数の課題に直面しています。追加のプロトン栄養細菌への光駆動プロトンポンプの非栄養栄養細菌への組み込み追加のプロトン動力を生産すると、生成された代謝ストレスを軽減するための多量のアデノシン-5'-三リン酸（ATP）を生成するためにいくつかの細菌ロドプシンが利用される。グルコースへの過度の依存とバイオエンジニアリング反応を支持することによって。我々は、大腸菌Lemo-21上の古代細菌、Gloeobacter Violaceusから機能的グロイオバクターロドプシンを発現し、その成長と代謝反応を評価し、そして酸化的リン酸化のための代替のプロトン動力を生み出しそして最終的にはタンパク質の改善に最適であることがわかりました。分子収量Gloeobacterロドプシンベースの大腸菌は、エネルギー源として光を使用する基本的な株として機能し、したがって生合成および創造的な毎日の用法のための有望な道を舗装する。
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Exeter
Title
CalcifEXE: A Bacterial Method of Calcium Carbonate Precipitation
Abstract
伝統的な炭酸カルシウム製造方法は、製造工程における化石燃料への依存のために、大量の二酸化炭素、ならびに多くの有毒化合物を放出する。私たちのチームは、炭酸カルシウムの沈殿に必要な炭酸イオンを生成することができる酵素で操作された細菌を使用して新規な沈殿法を開発しています。焦点を当てている1つの酵素は、溶液中の二酸化炭素と重炭酸塩の相互変換を促進する酵素である炭酸脱水酵素（CA）です。 Caは炭酸塩製造を増加させるだけでなく、大気二酸化炭素を炭酸イオンの供給原料として使用することもできなければならない。我々の方法は、ヒドロゲルと我々の操作された細菌を含む構造を印刷する3D-ビオプリンターと共に使用される可能性のある能力を有する。沈殿について炭酸カルシウムはヒドロゲル構造の形状をとるべきです。 1つの潜在的な用途は、サンゴの再成長を促進するために使用されるサンゴの骨格の製造です。
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Sorbonne_U_Paris
Title
The Chlamy Cleaner, a microalgae filter to purify water.
Abstract
2024年のオリンピックゲーム中、パリはセーイン内のトライアスロンの水泳イベントを開催したいです。しかし、水は汚染されています：農薬、ホルモン、抗生物質が存在し、環境や人間の健康に悪影響を及ぼします。私たちの目標は水を浄化するための解決策を開発することです。Chlamydomonas reinhardtiiをシャーシとして使用すると、これらの有害化合物を保持して劣化させることができる微細藻類フィルターを設計しました。私たちはアトラジン、禁止されている除草剤であるがセーヌではまだ検出された努力に焦点を当てました。ゴールデンゲートモジュラークローニング（MOCLO）を使用して、C. Reinhardtiiの細菌属Pseudomonasから4つの酵素を発現しました。この新しく添加された分解経路は、アトラジンを低い有害な製品に分解することを目的としています。さらなる安全性を確保するために、紫外線ヌクレアーゼ遺伝回路に基づく「キルスイッチ」装置を統合した。
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Tsinghua-A
Title
Medical Database Based On DNA Storage
Abstract
医療データは、人のための最も重要な種類のデータの1つです。人の健康とプライバシーを使ってやることがたくさんあります。DNAストレージは、多くの利点を持つ情報を格納する新の方法です。DNAストレージを使用してテキスト、画像、波形などを保存することで、個人のプライバシーの懸念なしに便利さをもたらす、この重要なデータを全員に管理するのに役立つ医療データベースを構築できます。
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Mingdao
Title
Cleandy, a candy that cleans your teeth
Abstract
歯の崩壊は子供の間で世界的に非常に普及しています。内的経口微生物バランスは口腔の健康を維持する上で極めて役割を果たす。今日、プロバイオティック治療は魅力的ですが、有効性が限られています。その結果、虫歯の主な原因であるStreptococcus mutanを排除できるプロバイオティックを設計しました。我々は、H 2 O 2輸送を促進するためのH 2 O 2、アクアポリン（AQP）遺伝子を生成するための大腸菌プロバイオティック株、ピルビン酸オキシダーゼ（SPXB）遺伝子を遺伝的に修飾し、H 2 O 2輸送を促進するためのH 2 O 2、Aquapol（AQP）遺伝子を生成し、そしてCatrase（KATG）遺伝子を、H 2 O 2を分解することによって酸化ストレスから復活させる。酸素と水。我々は、H 2 O 2アッセイにおいて、成長阻害およびS.Mutansの成長に対する拮抗的試験において概念の証明を首尾よく発表した。さらに、私たちはプロトタイプ、清潔な、キャンディーがあなたの歯をきれいにすることができます。糖アルコールと当社の操作されたプロバイオティック（GM ECN）で構成された清潔なものは、H 2 O 2を産生することによってS.Mutansに対する効果的な拮抗活性を示す実験で実証されました。
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HZAU-China
Title
Tooth Fairy
Abstract
エナメル質、歯の基本材料は、その配置が順序付けられてきつされている一種のヒドロキシアパタイトで、それを人体の最も難しい部分にします。それにもかかわらず、物理的なノック、酸浸食、細菌感染などの多くの理由により、日常生活の損傷を受けることがあります。エナメル損傷の初期段階では、歯の変化や口腔環境の変化に気づくことが困難です。しかし、後期の段階では、歯が腐敗したり破裂したりすると、馬鹿さえ損傷を受けた歯を完全に修理することができません。その上、治療は痛みを伴うかつ高価です。私たちの歯の妖精プロジェクトはこの問題に対する革新的な解決策であるかもしれません。歯の妖精には、彼女が損傷した歯エナメル質のための自動およびパーソナライズされた修理を提供することを可能にするいくつかの遺伝的回路が含まれています。さらに、ユーザーは歯の妖精の報告能力のために彼らの口腔の地位を知ることができます。
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Stuttgart
Title
LAC MAN - The effective water filter to counter drug residues in wastewater
Abstract
私たちのプロジェクトラックマンは、ラッカーゼを用いた医薬品Diclofenac（疼痛鬱病）およびカルバマゼピン（抗脂質）からの水精製に集中している。これらの物質はまだ完全に廃水から除外することはできません。多数の汚染物質を分解することができる酵素のクラスであるラッカーゼは、メソポーラスシリカフォームに固定化され、それらを長期持続可能でそしてより多くのpHおよび熱安定性にする。シリカ系材料は、環境にやさしい、生体適合性があり、有機溶媒や微生物攻撃に耐性があるため、よく適しています。酵素は私達の革新的なポリリジンタグを介してマトリックスに結合しているので、遺伝的に修飾された生物は環境中に放出されない。さらに、分解生成物はもう性質に悪影響を及ぼさない。 S.シアネウスのラッカーゼを発現し、シリカフォームを合成することができました。さらに、Michaelis-Mentenによる速度論モデルを介した固定化ラッカーゼの量に関して基質転換率を予測することができました。
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Edinburgh
Title
Finding NEMO The transcription-only biosensing platform
Abstract
私たちはエジンバラのIGEMチームで、Nemoを見つけてください！今年は、本当に革新的で効果的なものを作りたいと思いました。だからこそ、Nemo、転写のみ、およびバイオセンシングのための無細胞システムの発見を開発しました。材料の必需品を剥がすことで、私たちはバイオセンシングをより速く、安価でより安全にそしてより近いものにしました。我々はその後、合成RNA転写気泡およびT7 - RNAポリメラーゼによって媒介される等温増幅および基本的な論理処理システムを考案した。この基本システムには、転写因子、転写リボスイッチ、および直接オリゴヌクレオチドセンシングなどの従来のバイオセンシングモダリティの統合を検討した。当社の事例調査申請は環境水検査であり、業界のリーダーや規制当局に話しています。私たちのデザインがすべての環境に有益であることを確認するために、オープンサイエンスと国連の持続可能な開発目標を充実させました。
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Waterloo
Title
REMINE
Abstract
Readineは、電子製造廃水から有毒であるが貴重な重金属を除去し回収する金属結合タンパク質を含む充填されたカラムバイオリアクターです。放射線システムおよびタンパク質工学ツールを使用してタンパク質の金属親和性を増加させることによって、ラミーンシステムを標的とすることができる。プロセス工学的方法は、充填されたカラム反応器を設計し、それを特定の廃棄物流および調節上の制約に最適化するために使用されます。Readineを使えば、電子産業は私たちの環境や健康への影響を減らしながら成長し続けることができます。
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HK_CPU-WFN-WYY
Title
Cutinases - the Terminators of Microplastics
Abstract
ポリエチレンテレフタレート（PET）は、ポリエステルファミリーの最も一般的な熱可塑性ポリマー樹脂です。私たちのチームは、プラスチック製のパッケージからペットを分解するために1つ以上の適切なカチナーゼを探しています。我々は、カチナーゼがLCPETをテレフタル酸（TPA）およびエチレングリコール（例えば）に変換することができることを見出した。したがって、安全に低コストでカチナーゼを使用することで、PETの害を環境への害を低減することを目指しています。まず、カチナーゼの最適な作業条件を決定します。異なる種類のカチナーゼがそれらの能力、効率、および劣化の最適条件で比較されるであろう。さらに、これらのカッターゼが選択され、PETの劣化率に焦点を当てます。私たちは効率だけでなく、カチナーゼを使用してPETを劣化させることの安全性を検討します。したがって、私たちはプラスチックを消化するために合成生物学を通して塑性汚染を解決するために私たちの最大のものを試すためにここにいます。
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NJTech_China
Title
Pheromone revolution: mating pathway-based promoter engineering
Abstract
細胞融合は、施肥から器官形成まで、ほとんどの真核生物の全体的な発達に必要な基本的な生物学的プロセスです。出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeのフェロモン媒介嵌合は、細胞細胞融合を調査するために遺伝的にアクセス可能なモデル系を提供します。しかし、フェロモンの高額は関連研究の発展を制限しています。私たちのプロジェクトでは、より安い誘導物質に応答するシャーシを構築しようとしている、シグナル伝達経路を再構築するための変異体を構築しました。我々は、ほとんどフェロモン反応性プロモーター、PFUS2、PPRM1、およびPFIG1の3つの強度を特徴付けた。さまざまなコピー数と方向のフェロモン応答要素（PRE）を用いて、これらのプロモーター（天然と合成）の効率を革新的に評価した。我々の結果は、効率的な細胞工場およびバイオセンサーのための遺伝子発現レベルを細かく調整するためにプロモーターツールボックスを拡大する。
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DTU-Denmark
Title
RESHAPE: Tuning morphology and secretion in Aspergillus niger for improved industrial applications
Abstract
毎週、ほぼ60億人が真菌細胞工場の助けを借りて作られた製品を使用しています。これらの真菌の多くはAspergillus属から茎を生じています。菌糸体の形態と分泌に焦点を当てた合成生物学ツールボックスを作成することによって、Aspergillus Nigerの生産効率を向上させることを目指しています。形態学は特定の化合物の生産性に大きな影響を与え、適切な分泌は後の回収および化合物の精製にとって重要である。私たちは3つの方法で私たちの目標に近づいてきました：1）7つの形態関連遺伝子をエンジニアリングすることによるA. Nigerの形態学的変化を特徴付ける。2）撮像データに基づく菌糸体成長の計算モデルを確立する。3）タンパク質分泌のための天然および合成シグナルペプチドのライブラリーを開発する。バイオベースの製造プロセスの効率を向上させることで、それらを使用するための経済的インセンティブを改善し、化学産業における石油ベースの基板に重大な依存を低減することができます。
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Aalto-Helsinki
Title
SINISENS - A step towards cleaner waters
Abstract
マクロライド系抗生物質の存在は、数年間、水生環境におけるEU全体の監視のための医薬品の「時計リスト」に記載されているため、懸念が高まっています。それらは持続的であり、生物学的に活動的なままであるので、彼らは環境や人間の健康に有害である可能性があります。さらに、それらは抗菌性抵抗の発症を促進する可能性がある。様々な専門家によると、近い将来、マクロライド抗生物質のモニタリングに関する規制があるでしょう。しかしながら、それらを測定するための現在の方法は時間がかかり、高価であり、専門知識を必要とする。当社のソリューション、シナイゼンは、排水処理植物を排水処理植物を促進するように設計されており、マクロライド系抗生物質の濃度をモニターし、除去プロセスを最適化するために使用することができます。 Sinisensは、マクロライド抗生物質を検出するためにMPHRと呼ばれる転写因子を利用する遺伝子回路をベースとした光学的オンサイトバイオセンサーです。これらの化合物の存在下では、SINISENSは出力信号として緑色蛍光を生じる。
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NWU-CHINA-B
Title
Let'K dissolve（Let Kaempferol dissolve）
Abstract
Kaempferolは、優れた抗炎症性および抗ウイルス能力を有し、そしてCovid-19に対する漢方薬の一般的な成分である。しかしながら、貧弱な水溶性はその応用を制限する。カオフェノール、アストラガラリンおよびカオフェノール-3-グルコース-7-オキシジン - ラムノシドの誘導体の合成を触媒するために組換え工学的細菌を構築することによって2つのUDPグリコシルトランスフェラーゼが得られた。2つの誘導体間の水溶性および抗炎症特性の違いケムパロールを比較し、そして酵素反応の最適条件をモデル化することによって見出された。
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SUNY_Oneonta
Title
Confirming A2 Alleles using Luminescence in the Field (Ca2LF)
Abstract
アップステートニューヨークの小さな乳製品農家は、工場農場で生き残るのに苦労しています。利益を増やすために、いくつかの農民は特殊製品を生産しています。米国のそのような製品の1つはA2牛乳です。A2ミルクは、主乳タンパク質の1つであるベータカゼインの配列において、より一般的なA1ミルクとは異なります。ベータカゼインのA1 / A2対立遺伝子をコードする遺伝子は単一ヌクレオチド多型（SNP）によって異なる。A2ミルクは、健康上の利益を伸ばしたため、米国で人気が高まっています。私たちのチームは、A2群の繁殖を促進するための現地展開可能な遺伝的検査を創造することを目指しています。我々のシステムは、ベータカゼインのA1 / A2対立遺伝子に差別的に結合する5 'フラップエンドヌクレアーゼ（Flappase）およびクエンチカードオリゴヌクレオチドを利用する。正しい立体配座では、フラッパーゼはオリゴヌクレオチドを切断し、蛍光タグを採用します。このシステムを使用している乳製品農家は、繁殖のためにA2対立遺伝子を運ぶ牛を迅速に識別することができるでしょう。
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UCAS-China
Title
Stomach Homeostasis Establishment for Eluding the Plethora of H. pylori (SHEEP)
Abstract
小星状B612には、小さな王子がバオバブの撮影を引き上げる忙しかった。たまに彼らが成長したら、彼らの根は小惑星全体を部分に分割することができました。幸いなことに、B612は最終的に彼らを根強くすることなく急上昇するバオバブを撃つものを食べる羊を得ます。このようにして、小さな王子、バオバブの木々と羊は安定した生態学的バランスを与えます。この物語は、H. Pylori関連疾患の治療に関する私たちの新しいアイデアを提示します。H. Pyloriは6万年以上にわたり胃の中で人間と共生しています。そのペレトラや消失のどちらかが人体のさまざまな病気を与えます。現在の治療により推奨される完全な除去は満足していません。したがって、我々は、微生物のバランスを実現するために、L. Acidophilusを胃に導入した「羊」療法を提案した。パーソナライズされた治療を目指して、カプセルロボットの胃のサンプリングと撮影からのデータを入手します。三成分平衡関係モジュールもシミュレートされます
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BGU-Israel
Title
WIPEOUT - Wipes out wet wipes of the environment!
Abstract
過去20年間で、ウェットワイプの使用は世界中で一般的になっています。トイレによる湿った拭き取りの処分と下水道システムにおける蓄積は広範囲の損傷を与えます。イスラエル単独では、下水道システムへの湿った拭き取りの損傷を修復することは、年間3,360,000ドルで推定されています！「ワイプアウト」は、下水および水システムの国内汚染の生分解のこの未発電性の世界的な問題に対する主要および革新的な解決策を提示しています。細菌表面表示システムを用いて、下水道システムの細菌集団を遺伝的にエンジニアリングすることを含む生物学的方法を利用することを目指しています。私たちの最終目標は、下水道システムにおけるセルロース繊維拭き取り拭き取りの蓄積によって引き起こされる目詰まりの問題を解決し、他のフラッシング固体と脂肪と一緒に積み重ねられた「ファットベルグ」の世代を防止することです。この問題に対する解決策を見つけることによって、生態学的および経済的損害の両方を防ぐことができるかもしれません。
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RDFZ-China
Title
Tea-HEE
Abstract
うつ病は世界中で世界的に深刻な病気で、32200万人以上をもたらします。セロトニン欠乏症が鬱病の主な原因であることが受け入れられ、この状況を改善するために薬物が作られています。それでも、患者はしばしば圧力を感じ、社会的なStigmaS.ourプロジェクト、茶喜びのために抗鬱剤を倒すことを拒否します。私たちは患者の腸内に配置されるE. Coli Nissle 1917（FDA承認プロバイオティック）を設計しました。それはPCAによって茶吸入由来のティー代謝物によって活性化され、そして5-HTPを生産することができ、セロトニン合成に複数の利点を有する腸に天然に存在するセロトニンの前駆体を生産することができる。したがって、一般的な飲み物、患者は腸内で5-HTPの十分な供給を受けることができ、したがって圧力なしでより良い生活の質に向かってうつ病に耐えるために彼らの脳内のセロトニンの十分な供給を得ることができます。
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NUDT_CHINA Title
Predator Pro: a modularized toolbox for signal-controlled Targeted Protein Degradation
Abstract
タンパク質存在量の経時的制御は合成回路の堅牢性と動力学にとって重要です。タンパク質合成を操作するために複数のアプローチが開発されているが、タグガンタンパク質分解を正確に制御するためにいくつかの道具が実証されている。ここでは、IGEM 2018-19で示された捕食者システムに基づいて、標的タンパク質分解のための標的タンパク質分解のためのモジュラ化された信号制御可能な方法を提示する。合理的にTRIM21タンパク質によって、TRIM21と抗体Fcドメインとの間の相互作用を他の構成的または誘導性のタンパク質二量体化対と置換することができることを実証した。我々は、構成的DOCS - COH2相互作用またはラパマイシン誘導FRP - FKBP相互作用が、未タグなEGFPタンパク質の構成的または薬物制御の分解を可能にすることを証明した。タンパク質存在対照のための現在の合成生物学的ツールの効果的な拡大として、このシステムは制御されたタンパク質分解のためのモジュール化された便利なプラットフォームを提供し、これは基本的な研究および臨床応用に適用され得る。
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ZJU-China
Title
MagHER2some
Abstract
乳がんは女性の健康を脅かす主悪性腫瘍です。 MRIに使用されている現在の造影剤の未定特価および副作用を克服するための努力において、我々は磁気的細菌Magnetopirillum gryphiswaldenseからの磁気吸虫性を再構築して、HER2陽性乳癌細胞を特異的に標的とする高い生体適合性を有する造影剤を生成する。生物学的修飾では、磁気吸虫筋は抗HER2抗体と結合することができる。抗原 - 抗体相互作用により、エンジニアリング磁気吸虫性はHER2陽性乳癌細胞と共役し、磁場下での画像上の特別なパターンを実証することができる。当社の設計された造影剤Magher2someで武装して、HER2 - ポジティブ乳がん治療の治療の応答を評価する効率を最適化し、したがって治療プロセスの進行を支援することができる。さらなる用途は、さまざまな病気を標的とするバイオマーカーを備えたプラットフォームを設立することで、他の病気の正確な評価のための舗装道を舗装することができます。
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BHSF
Title
Khronos: The Timer Yeast
Abstract
家で焼くとき、人々は常に他の問題からの経験と妨害のために彼らのパンをオーバー発酵させています。しかし、発酵は焼成中の最も重要なプロセスです。したがって、我々は、適切な時点で発酵を停止するために栄養膜ベーキング酵母の遺伝子を修飾するという考えを思い付きました。トグルスイッチに基づく回路を設計しました。誘導剤ガラクトースを添加する前に、スイッチを「オフ」状態に保ち、ここで栄養菌を表すタンパク質が発現し、ガラクトースを添加した後、スイッチは以前に抑制された遺伝子の蓄積によってオンにされる。次いで、相補的タンパク質の遺伝子と共に他の遺伝子をシャットダウンし、それらの濃度が低下し、ある期間にわたる発酵を終了させる。
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Jiangnan_China
Title
Sophorolipid: Biosynthesis of fine-tuned acid/ lactone ratio in Starmerella bombicola based on CRISPR/Cas9
Abstract
シアノバクテリアの花は、水質汚染の世界的な問題に徐々に進化しています。環境に優しいバイオ界面活性剤であるソフォロリピドは、シアノバクテリアを効果的に分解することができます。酸性ソフィオロ脂質はより良好な界面活性剤活性を有し、ラクトンソフィロ脂質はより良好な静菌効果を有する。しかしながら、野生型Starmerella Bombicolaによって産生されたソフォロリピドは、これら2つのタイプのランダムな混合である。より高い収率のソフォロリピドを得るために、これら2つのタイプの利点を組み合わせるために、Jiangnan_chinaはStarmerella BombicolaにおいてCRISPR / Cas9遺伝子編集系を、UDP-グルコシルトランスフェラーゼB（UGTB）をオーバーエフラクサ）し、そしてLactonase（Sble）発現レベルを調整した。異なるプロモーターを使用する。最後に、当社の期待と一致する組換え株を構築し、シアノバクテリアを分解する最大効率を達成する適切な比率で軟液脂質を生成した。
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UESTC-Software
Title
CPD3DS-Classification of Protein Domains in 3D Shape to design a standard set of protein bricks
Abstract
タンパク質は細胞内のほとんどの生理学的機能を担うため、多くの合成生物学者が要求に応じてカスタマイズされたタンパク質の設計に焦点を当てています。今日、タンパク質設計はほとんどの場合、ワークロードは間違いなく大きなものである。同時に、タンパク質の構造はしばしばタンパク質の機能と密接に関係している。当社のプロジェクトCPD3DSは、構造ドメインを基本単位として直接使用してタンパク質構造を分析する。一連のタンパク質レンガを入手するために、ドメインはそれらの形状機能によって分類され、3D- Zernike記述子は既存のデータベース内のすべてのドメインをクラスタ化するために使用されました。分類されたタンパク質ドメインの検索、分析、および視覚化のために、CPD3DSと呼ばれるユーザーフレンドリーなウェブサイトを開発しました。また、合成生物学を教えるためのタンパク質レンガのセットを印刷しました。
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ZJUT_China_B
Title
Multivirus Monitor
Abstract
COVID-19の世界的なパンデミックは、ウイルスを検出することの非常に重要なことを強調しています。 1つの鍋で複数のウイルスを検出する可能性があるPoint-expare診断におけるCRISPR CAS13のアプリケーションとして「マルチウイルスモニタ」を構築することを目指しています。 CAS13オルソログとその配列固有のレポーター間の特異性をテストすることによって、プラットフォームの実現可能性をテストしました。サンプル処理、増幅および検出チャンバを組み合わせたマルチサーブ検出装置を設計しました。蛍光検出に基づいて、検出結果を処理して移動端末に送信して結果を見えるようにすることができる。私たちは "Virusee"という対話型プラットフォームを設計しています。これはユーザーに最適な解決策と提案を提供する可能性があります。さらに、「Vivalibrary」というデータベースを構築しています。これは、ユーザーにウイルス情報とそれに対応するCRRNAを提供する可能性があります。迅速なポイント診断のためのマルチウイルス検出およびフィードバックプラットフォームとして想像された、マルチウイルスモニタは、ウイルスに対する予測不可能な戦いの有望な武器になる可能性があります。
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TUDelft
Title
PHOCUS - Target locusts from within
Abstract
古代の歴史以来、バッタの疫病は作物や牧草地を壊滅させ、世界中の食料安全保障を脅かしています。バッタ群と戦うための現在の戦略は、他の昆虫に害を及ぼす、または遅すぎるバイオ農薬に特異的で危険な化学農薬を頼りにしています。私たちの使命は、高速で安全なバッタに対抗した新しいバイオ農薬を提供することです。我々は、ローザストの腸内細菌に感染する設計されたバクテリオファージに基づくバイオ農薬であるPhocusを導入する。感染後、細菌はバチルスThuringiensis（BT）から特異的に害を及ぼすBacillus thuringiensis（BT）からの結晶タンパク質（Cry7ca1）を生成し、全てファージゲノム内でコードされています。Cry7ca1は、腸の裏地を穿刺し、バッタを傷つけ、RNAi前駆体が血リンパに到達することを可能にし、そこでそれらが成熟し沈黙の発現に到達することができます。このユニークな補完的アプローチでは、Phocusは中からバッタを殺します。
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NAU-CHINA
Title
Soil lead immobilization magician(SLIM):earthworms carrying engineered Bacillus subtilis
Abstract
土壌中の鉛汚染は農業や人間の健康に大きな損失をもたらしました。しかしながら、物理化学的修復や植物の濃縮などの伝統的なアプローチは、それぞれ他の危険を引き起こし、効率が低いでしょう。したがって、鉛汚染治療のための新しい戦略を開発することは緊急です。今年は、伝統的な方法の欠乏を補うために、ナウチナウチンシャル兼ミミズ（Eisenia foetida）と細菌（枯草菌）を固定するための細菌（枯草菌）。ミミズは細菌の担体として使用され、そして我々は、酸素調節スイッチを使用してミミズの腸内でフィチン酸塩を加水分解することによって細胞血管を分泌するように変態した。リン酸と塩化物イオンと組み合わせることによって、リードイオンを不溶物に沈殿させることができ、したがって土壌を浄化することができる。一方、環境中の遺伝子改変生物を使用することの生物性を考慮した自殺モジュールを追加しました。 Covid-19の影響を受けて、実験はできません。それでは、文献からデータを収集し、結果と実現可能性を予測するために数学モデルを構築しました。
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Ionis_Paris
Title
BacTail : Target, Kill and Self-Destroy, an innovative way to fight against antimicrobial resistance
Abstract
抗生物質の発見以来、それらの標準的かつ繰り返し使用は治療が存在しない耐性細菌の外観をもたらした。これは、Ionis Paris 2020チームが対応しようとしている主要な医療問題です。BACTAILは、3つの主な能力を持つテーラー製の治療用細菌を設計することを目的としています：ターゲット、殺害、そして自己破壊。第一段階は、バクテリオファージの特定の認識能力によって触発される。我々は細菌の表面にそれらの結合タンパク質を表現します。病原性標的に結合した後、我々の細菌はそれを殺すために特異的な抗菌ペプチドを分泌するであろう。環境安全の目的のために、彼らの普及を防ぐために、私たちの細菌は統合されたキルスイッチシステムで設計されています。その使命が完了すると、それは自己破壊するでしょう。全体として、バチールは安全かつ局所的に抗生物質耐性バクテリアを標的として殺すための革新的な方法です。
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Bielefeld-CeBiTec
Title
WavySense: Don't take your hormones, measure them!
Abstract
あなたは避妊について考えたことがありますか？あなたはほとんどの避妊薬が侵襲的であり、深刻な副作用を持つことができますか？新しく、革新的で非侵襲的な方法が必要です。確実にユーザーの出生率を報告するもの。したがって、私たちはWavySenseを開発しました。副作用を欠く女性の支援と力を与えて男女平等に貢献しました。 。電子モジュールは圧電結晶中に波を誘起する。これは、表面上の質量変化によって位相シフトされる。比較のために、大腸菌および単鎖可変フラグメントにおいてホルモン特異的抗体を製造した。結晶の金被覆表面に固定化された抗体 - 抗原結合は、電子機器によって検出され、そして私達のユーザに優しいアプリに移される位相シフトをもたらす。最近の測定値を追跡、評価し、視覚化し、現在の出生率の状態を表示します。
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Lambert_GA
Title
AgroSENSE
Abstract
2350万人以上のアメリカ人が食料不安に直面しているか、または手頃な価格で新鮮な食材へのアクセスが限られており、栄養不足につながります。 Aquaponicsは食物の不安定に対処するための実用的な解決策ですが、メンテナンスとコストは実装に対する障壁です。 Lambert IGEMのAgroSenseは、植物の成長を最適化するために栄養レベルと環境条件を監視および分析するために、モジュール式ハードウェア、栄養性バイオセンサー、およびIOS / Android互換性のあるソフトウェアを利用しています。私たちのアルドイーノセンサーは環境条件を測定しますが、バイオセンサーはリン酸塩と硝酸塩栄養バランスを監視するために利用されています。大腸菌の天然のPhOおよびNARシグナル伝達経路に基づくBiobricksを特徴付けました。これらの栄養素の存在下でのGFPの発現は、フルオロ-Q、私達の改良されたフルガル蛍光光度計によって分析される。データは私たちのAGRO-Qモバイルアプリによって定量化され、エンドユーザーがAquaponicsシステムに関する情報に基づいた決定を下すことができます。教育カリキュラムの統合を重視して、agrosenseは将来の農業バイオテクノロジーイノベーションのためのモデルとして役立ちます。
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OhioState
Title
Biocontainment Reimagined
Abstract
合成生物学の分野は、より幅広い公衆に受け入れられることに対する1つの大きな障壁を有する。私たちが使用する生物が無害であることを知っているかもしれませんが、ほとんどの人は同じ結論に来るために必要な背景の知識を持っていません。合成生物学製品の安全性と自信を高めるための最良の方法は、遺伝子バイオコンテンメントシステムを添加することで、私たちの微生物の寿命を統制する遺伝子とゲノム編集である遺伝子バイオコンテンメントシステムを追加することです。これらのシステムは、プロモーターや毒素の小さな遺伝回路からの範囲であり、ゲノムの書き換えを完了し、それらのすべてをシンプルで柔軟なデータベースにまとめました。これを付随するために、私たちは予測モデルと教育媒体を開発しました。これは、生物学を実現しやすくすることを簡単にするという表明で、公共の使用のためにより安全に安全になりました。
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TAU_Israel
Title
sTAUbility - an innovative approach to increase the genetic stability of heterologous genes
Abstract
合成生物学の分野における重要な課題は、導入された遺伝子のゲノム不安定性である。遺伝子が宿主生物に挿入されると、それは追加の代謝荷重を引き起こす可能性があり、ホストフィットネスを大幅に減少させることができる。したがって、導入された遺伝子を損傷する突然変異は、その発現を減少させるために選択される可能性が高い。これらの突然変異は、合成生物学的製品を時代遅れにすることができ、そして常に維持を必要とする。我々は、同じプロモーターの下で、宿主のゲノム内の必須遺伝子のN末端に標的遺伝子を連結することを提案する。このようにして、標的遺伝子上の突然変異は不可欠な遺伝子の発現に影響を及ぼし、変異宿主の死亡率をもたらす可能性が高い。我々は、生体形成性モデルおよび安定性を測定するための新規なアプローチに基づいて、所与の標的遺伝子および所与の標的遺伝子への最良の不可欠な遺伝子およびリンカーに一致するStaubilityというソフトウェアを開発している。さらに、固定性は効率的な遺伝子発現のための組み合わせ構築物を最適化し、安定性が高まっています。
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HK_HCY
Title
Reducing biofilm formation in Lactobacillus fermentum: Targeting intervention on the AI-2/LuxS quorum sensing system
Abstract
Lactobacillus sp。バイオ燃料の中で最も豊富な細菌汚染物質です。それらの中で、L. Fermentumは最も一般的なものであり、バイオエタノール生産における微生物種の50％の相対存在量を占めています。私たちの提案された研究では、特別なクォーラムセンシング（QS）関連特徴があるL. Fermentum 2-1、自動INDUCER-2（AI-2）の生産量を与えられた特別なクォーラムセンシング（QS）関連特徴は、二重断面の影響について検討されます。バイオフィルム形成におけるAI - 2 / LUXS QSシステムの介入定量的消光アプローチの1つは、Streptococcus suisにおいて特異的にルクスを阻害することが示されている推定上親和性ペプチドリガンドを使用して、LUXS（AI - 2シンターゼ）の活性を阻害することであろう。第二のアプローチは、キナーゼラークを用いて細胞外に細胞外に分解することであろう。私達は私達の二重の介入を通してバイオ燃料中のバイオフィルムの形成における効果的な抑制を達成することを望みます。
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Vilnius-Lithuania
Title
FlavoFlow - a comprehensive exogenous fish infections detecton, treatment and prevention strategy
Abstract
魚の消費率の高まりは、海洋文化農場を環境の持続可能性と互換性のある魚の生産を競合させる再循環型養殖システムを実装しました。これらのシステムが陸上資源の使用を低減しても、そのようなシステムにおける水再循環は細菌性またはウイルス感染のために著しい損失を引き起こす可能性があります。魚感染症の一般的な病原体はフラボバクテリウム属細菌であり、これは最初の感染の数日後に魚の死を引き起こす可能性があります。できるだけ早く感染を検出するために、我々はヘリカーゼ依存性増幅および横流アッセイ法に基づく迅速な検出試験を開発した。さらに、抗生物質消費量の減少を目的として、定量検知機構およびエキソリシンタンパク質に依存する新規な治療方法を作成しました。最後に、次の感染を防ぐために、私たちの3番目の目標は、アルギン酸塩ビーズにカプセル化されたサブユニットワクチンに基づく予防システムを提供することです。
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Gaston_Day_School
Title
Eliminating Kudzu to Restore Natural Habitats for Crops and Endangered Species
Abstract
クジズを削除するために、農民と電力会社はしばしば彼らの土地に有害な化学物質をスプレーする必要があります。これらの化学物質は、他の多くのKudzu除去オプションと共に高価であり、人間の健康と生態系に有害な影響を与える可能性があります。Pseudomonas Syringae PV。Phaseicoloolaは、フィト毒素位相オキシンを製造することによって、特にマメ科植物に影響を与えることがわかった。当社のチームは、大腸菌における転移毒素産生経路を複製し、毒素をより環境にやさしい選択肢として利用することを計画しています。Kudzuを除去した後、地元の絶滅危惧種は競争なしに再成長することができます。さらに、クジズをベクトルとして抱きしめされているアジアの大豆錆のような感染植物疾患の普及をシミュレートし、強みを伴うプロモーターの下での腐敗ケースの生産と活動をシミュレートし、局所地域の九洲の普及費用を予測しました。
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Cornell
Title
Lumicure
Abstract
今年、コーネルIGEMは癌性悪性腫瘍のための細菌療法治療と追跡システムを設計することを目指しています。このシステムは、癌性腫瘍が免疫増殖性微小環境を有し、悪性腫瘍が体の他の部分に血流を通って移動するという事実を利用することを目的としています。大腸菌を腫瘍の高乳酸環境の外で生存しないようにして、乳酸誘導性毒素 - 抗毒素系（GHOS / GHOT）を設計しました。これらの大腸菌細胞はまた、当社の蛍光検出システムによって検出可能な蛍光タンパク質であるMCARDINALを構成的に発現するように操作されるであろう。この検出システムは、主に励起フィルタと放射フィルタ、ダイクロイックミラー、レーザー、およびラズベリーPIマイクロコントローラからなる。私たちは、この治療システムの概念実証を行ったことで、この治療システムの概念が後で行って後に治療することができることを願っています。
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iBowu-China
Title
Sureloc (Surely Locates Cancer)
Abstract
非小細胞肺癌（NSCLC）は、化学療法または放射線療法に敏感ではない一般的な種類の上皮癌です。この問題に取り組むために、私たちのチームは磁気温熱療法に基づく治療を開発しました。腫瘍特異的プロモーターを用いて磁性タンパク質結晶（MPC）をコードするベクターを設計した。 MPCベクターを担持する表面PEG Ge11の修飾を有するリポソームは、NSCLC細胞を標的とするであろう。トランスフェクション後、標的腫瘍細胞はMPCを発現し、それは鉄の結合を可能にする。鉄荷重MPCは、局所的な交流磁場に応答し、細胞死を誘発する。活性標的化リガンド、腫瘍特異的プロモーター、および局所的な交互の磁場はトリプルターゲティングセキュリティを提供する。現在、磁気の確認が成功したMPCのin vitro単離と精製を完了しました。連続するステップは、MPCのサイズを制御し、内部ターゲティングリガンドを追加し、インビボでターゲティング機能を実験することです。
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KUAS_Korea
Title
Thermopatch : What's your body temperature now?
Abstract
CoviD-19の制御における韓国の成功への重要な要素の1つは早期発見です。韓国の攻撃的なCovid-19テストとは別に、韓国はまた、審査目的で室内公共施設すべての公共施設のエントリーで温度チェックを展開しました。しかしながら、非接触温度計および赤外線カメラなどの現在のスクリーニング方法は、スクリーニングブースのセットアップに必要なリソースのコストとその温度を連続的に監視するために必要とされているため、効率的ではない。私たちの「ThermoPatch」は、これらの制限を補完する装置です。この方法では、露光RNAアプタマー（「触媒ヘアピンアセンブリ（CHA）」法を特異的に利用し、そして熱測定RNAを利用した。私たちは最終的に私たちの「Thermopatch」が人々がこれらの困難な時期を通過するのを助けることを願っています。
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SUSTech_Shenzhen
Title
Developing a Small Molecule to Inhibit Phage Infection of Bacterium Pseudomonas
Abstract
Pseudomonasは、特にバイオレメディエーションおよび生体触媒の分野において、異なるバイオテクノロジー用途に大きな可能性が高い。例えば、80％以上のビタミンB12は、工場でP.Denitripificansによって合成される。我々は、標的指向性スクリーニング技術を利用して、感染症中に臨界タンパク質の翻訳を破壊する小分子を見つけようとします。Silicoスクリーニングでは、ソフトウェア分子運転環境を用いて行い、さらなる試験により有効化合物を確認した。
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UFlorida
Title
Aquatic Phosphorus Detection Using SCRIBE
Abstract
Team Florida 2020は、2019年のプロジェクトからインスピレーションを受けて、リンレベルを実際の生態学的意義に検出し記録する新規のバイオセンサー技術を改善し適用します。このプロジェクトは、生物学的イベント（スクライブ）システムを統合する合成セルラーレコーダを大腸菌中の天然に存在するPhOB-PHORシステムと結合しています。リンに応答して、スクライブは逆転写酵素を利用して、細菌染色体内の突然変異をもたらすベータリコンビナーゼタンパク質を使用してDNA複製中に宿主ゲノムに組み込むことができる一本鎖DNAを産生する。このシステムは、一世代あたりの突然変異を得る細胞の割合をモデル化することによって、水体中のリンの量を測定するために利用することができる。ラボがない場合、UF IGEMチームはこの仮想バイオセンサーを2部品プロジェクトの一部としてモデル化しようとしています。
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UofUppsala
Title
NANOFLEX
Abstract
私たちのプロジェクトは、あなたの選択の分析物を検出するために適応可能な細胞バイオセンサーを作成することを目的としています。その設計は、ナノボディがターゲットと相互作用し、シグナル増幅モジュールを作動させる感覚モジュールを含みます。これにより、裸眼には出力信号が表示されます。このシステムを使いやすい形式で配置する標準化された、柔軟でアクセス可能な検出システムを提供するつもりです。
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UCSC
Title
Komaplastics: Creating a biodegradable bed mulch from bacterial cellulose
Abstract
プラスチックベッドマルチフィルムは必須の農業用具です。それらは燻蒸排出量を制限し、紫外線および耐水性を提供し、雑草および害虫の成長を防ぎ、そして作物収量を最大化する。しかしながら、現在の処分方法は持続的ではない。ベッドマルチの大多数は埋め立て地に捨てられ、有害な化学物質に劣化し、地域社会の汚染を汚染します。 KOMAPLASTICSは、Komagatoibacter Rhaectsによって産生された細菌セルロース（BC）から生分解性ベッドマルチを作成するための基盤を築きます。 BCは、可塑化分子の均質化に対する障壁である隣接鎖の水酸基間の水素結合のために、高結晶性である。したがって、我々は、これらの水素結合ネットワークを破壊しそして可塑化分子の添加を容易にする可能性について炭水化物結合モジュール（CBMS）を調べた。化学的に復活させたBCを可塑化する能力のために様々な化合物を試験した。我々の研究は、生物学的系で産生されるセルロースベースの生分解性プラスチック床マルチフィルムの開発のための足場を提供するであろう。
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まとめ
いかがでしたでしょうか？
大変多くのチームが、オリジナリティ溢れたプロジェクトを行っていることがわかっていただけたかと思います。まだ1/4ほどのチームですので、また次回もお楽しみにしていただければと思います。